Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  106989029

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   

This is table  24  of  322  ( 38559 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6972635--6972693
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22
80
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22
0
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2.0
15
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0
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2.6
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4
0
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12
3.0
12
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4
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1.63
6979666--6979775
3
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3
70
13
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3
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1.31
6983042--6983083
22
1.9
22
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24.0
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19
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2
0
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1.09
6990700--6990788
30
2.8
31
78
18
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34
3
0
61
1.12
6994645--6994683
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3.7
10
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10
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2
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1.64
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213
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2
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0
0
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9
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30
0
0
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20
2.0
20
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0
0
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1.72
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2.0
20
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64
0
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1.20
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0
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2.0
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41
30
3
24
1.72
7043267--7043470
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3.5
53
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19
138
26
14
22
36
1.92
7043191--7043471
122
2.3
122
98
0
544
27
14
22
35
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7043672--7043888
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4.0
55
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8
313
29
16
17
37
1.91
7043805--7044047
123
2.0
124
86
4
346
25
15
22
36
1.94
7044031--7044064
16
2.1
17
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5
52
17
11
5
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1.45
7043970--7044219
91
2.8
90
83
8
307
27
18
18
35
1.95
7043970--7044228
85
3.0
87
82
8
305
27
18
18
36
1.93
7044316--7044349
16
2.1
17
88
5
52
17
11
5
64
1.45
7044260--7044474
87
2.4
89
86
6
285
27
17
19
35
1.94
7044418--7044635
54
4.1
55
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315
28
16
17
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1.91
7044907--7045008
30
3.4
31
83
5
122
29
22
3
44
1.71
7045393--7045436
9
4.8
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5
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0
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13
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12
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0
18
0
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2.0
33
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5
82
74
0
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1
0.90
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23
2.3
22
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3
84
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5
25
1
1.24
7045551--7045590
10
4.0
10
83
0
53
72
2
25
0
0.97
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17
3.9
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80
1
17
0
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2.0
23
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8
65
82
2
15
0
0.77
7045711--7045760
16
3.2
16
88
5
77
84
0
16
0
0.63
7045912--7045949
16
2.3
17
86
4
51
23
0
2
73
0.95
7046307--7046365
16
3.5
16
76
15
57
33
15
8
42
1.77
7046058--7046438
17
21.3
18
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15
166
32
12
6
47
1.68
7046470--7046517
18
2.7
18
87
6
62
39
14
6
39
1.71
7046585--7046657
19
3.6
21
85
12
91
42
8
10
38
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7046589--7046657
21
3.4
20
82
11
70
44
8
8
37
1.66
7046636--7046760
17
7.1
17
63
21
53
32
10
12
44
1.76
7046531--7046657
20
5.9
19
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26
60
39
11
9
40
1.73
7046638--7046668
16
1.9
16
93
0
53
25
12
12
48
1.77
7046574--7046697
39
3.2
37
74
16
101
37
8
9
44
1.67
7046589--7046695
19
5.5
19
68
24
55
40
8
9
42
1.67
7051353--7051572
118
1.9
116
92
3
370
44
9
5
41
1.58
7051522--7051565
19
2.3
19
84
0
52
50
9
0
40
1.34
7065045--7065120
18
4.2
18
83
6
91
32
22
11
32
1.90
7070005--7070047
19
2.3
19
92
4
70
76
9
9
4
1.14
7070186--7070232
19
2.5
20
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10
62
65
2
31
0
1.04
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19
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13
60
17
0
12
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1.17
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72
2.0
72
94
0
246
33
20
25
20
1.97
7077500--7077541
18
2.5
17
80
7
50
38
0
7
54
1.28
7077672--7078194
151
3.5
153
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3
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28
8
7
56
1.55
7078120--7078294
86
2.0
86
94
2
307
29
4
5
61
1.37
7077672--7078208
149
3.6
149
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3
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28
8
7
56
1.54
7078189--7078241
13
4.3
12
75
11
54
20
3
1
73
1.08
7078142--7078319
86
2.1
86
84
4
225
30
6
6
57
1.48
7078235--7078512
133
2.1
135
85
4
373
28
8
6
56
1.55
7079092--7079171
3
27.0
3
70
16
51
1
33
0
65
1.01
7079106--7079164
16
3.8
16
74
17
61
1
35
0
62
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7084232--7084323
48
1.9
48
97
0
175
43
20
7
28
1.79
7091586--7091636
20
2.7
19
79
11
52
66
1
1
29
1.13
7092004--7092060
23
2.5
22
78
13
62
68
3
1
26
1.15
7095526--7095559
17
1.9
18
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5
52
44
0
0
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3
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0
50
0
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36
0
0.94
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21
2.2
22
92
3
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21
19
38
21
1.94
7104183--7104220
18
2.1
18
95
0
67
42
47
2
7
1.46
7104197--7104221
13
1.9
13
100
0
50
40
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0
12
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2.1
16
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52
26
0
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0
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0
7
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0.89
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17
2.2
18
90
9
60
67
2
0
29
1.04
7134942--7135159
107
2.0
107
100
0
436
29
26
16
27
1.97
7135937--7135996
30
2.0
30
86
0
84
13
23
16
46
1.82
7140073--7140124
18
3.1
16
82
15
61
67
3
0
28
1.08
7139887--7140419
266
2.0
266
100
0
1066
48
11
11
28
1.74
7140339--7140390
18
3.1
16
82
15
61
67
3
0
28
1.08
7144750--7144811
27
2.3
27
86
8
90
35
0
3
61
1.12
7144746--7144798
18
2.9
18
80
2
61
33
0
3
62
1.13
7144787--7144826
19
2.2
17
91
8
62
45
0
0
55
0.99
7145841--7145900
27
2.3
27
97
2
113
15
6
30
48
1.70
7147258--7147358
9
10.7
9
70
12
60
43
0
2
52
1.23
7148863--7148896
16
2.1
16
88
0
50
50
14
17
17
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7151695--7151735
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
7153641--7153674
16
2.1
16
88
0
50
50
14
17
17
1.79
7154318--7154344
12
2.2
12
100
0
54
40
18
14
25
1.89
7154688--7154732
21
2.2
20
84
11
56
75
4
2
17
1.07
7163170--7163195
13
2.0
13
100
0
52
7
23
7
61
1.49
7164999--7165148
72
2.1
72
93
1
255
29
18
13
39
1.88
7169509--7169582
37
2.0
37
100
0
148
16
18
13
51
1.76
7175714--7175740
12
2.2
12
100
0
54
25
14
14
44
1.84
7180896--7180981
27
3.2
26
85
4
109
38
19
20
20
1.94
7182043--7182074
17
1.9
16
93
6
55
68
0
25
6
1.12
7185989--7186124
46
3.0
46
85
2
175
41
14
23
20
1.89
7194011--7194061
11
4.5
11
72
13
50
29
0
3
66
1.09
7198956--7199088
47
2.8
47
96
0
239
39
21
13
25
1.90
7199877--7199901
4
6.2
4
100
0
50
0
24
0
76
0.80
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26
2.0
25
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4
82
18
22
24
36
1.95
7210176--7210231
25
2.2
25
93
0
94
26
26
17
28
1.98
7233498--7233559
30
2.1
30
96
0
115
27
3
11
58
1.48
7240664--7240718
24
2.3
24
87
0
74
47
0
3
49
1.19
7240672--7240743
18
3.6
19
68
21
58
43
0
4
52
1.20
7246157--7246244
28
3.1
28
100
0
176
25
10
11
53
1.68
7247148--7247201
22
2.6
21
77
11
58
72
5
3
18
1.20
7247313--7247390
38
2.2
34
80
13
86
47
2
5
44
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7247659--7247692
2
17.5
2
87
6
52
47
0
0
52
1.00
7250405--7250447
19
2.3
19
87
0
59
39
2
4
53
1.34
7252567--7252604
3
12.3
3
94
5
67
68
0
31
0
0.90
7255367--7255452
24
3.5
24
68
14
59
52
2
3
41
1.31
7258247--7258326
41
2.0
41
89
0
124
27
7
32
32
1.85
7269456--7269522
28
2.5
26
81
9
80
37
0
4
58
1.19
7269456--7269522
27
2.5
27
83
7
82
37
0
4
58
1.19
7279090--7279130
18
2.2
19
87
12
59
29
21
0
48
1.50
7279235--7279292
23
2.5
23
100
0
116
46
43
3
6
1.47
7279785--7279841
15
3.7
16
79
9
73
49
8
1
40
1.44

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322