Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr1
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  106989029

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   

This is table  265  of  322  ( 38559 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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1.94
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168
1.9
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57
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0
48
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87999945--88000292
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2.0
175
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19
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16
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56
27
1
21
50
1.57
88006795--88006875
23
3.5
23
72
22
80
23
1
24
50
1.56
88006886--88006926
22
1.9
21
85
14
57
19
0
24
56
1.42
88010850--88010898
21
2.3
21
89
0
71
38
14
38
8
1.76
88016377--88016412
18
1.9
19
88
5
56
50
0
5
44
1.25
88023459--88023514
29
1.9
29
85
0
76
58
3
0
37
1.15
88023441--88023509
21
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21
70
9
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60
4
0
34
1.16
88029379--88029431
23
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23
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0
97
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16
1.92
88035978--88036026
21
2.5
19
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9
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53
2
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1.32
88041058--88041092
17
2.0
18
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0
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1.34
88045933--88046042
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29
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1.80
88046188--88046222
18
2.0
17
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0
0
45
0.99
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156
2.0
157
96
0
576
43
3
5
47
1.42
88046324--88046365
15
2.7
16
82
14
52
52
2
0
45
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88046333--88046374
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2.9
15
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52
0
0
47
1.00
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97
2.4
97
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0
472
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13
40
1.75
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13
2.1
13
100
0
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37
0
7
55
1.28
88056685--88056730
20
2.4
18
85
7
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0
0
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19
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0
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88061672--88061721
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0
4
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28
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3
4
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2.0
20
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1.24
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1
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1.64
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2.0
18
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1.13
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1.42
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17
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12
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0
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0.99
88075560--88075609
18
2.8
18
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0
64
0
56
0
44
0.99
88076546--88076584
20
2.0
20
89
0
60
48
12
10
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1.74
88076568--88076607
14
2.9
14
84
0
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42
17
7
32
1.77
88076841--88076879
18
2.2
18
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4
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41
0
0
58
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13
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0
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52
0
0
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1.00
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21
2.6
21
85
8
76
27
38
7
27
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
88077193--88077218
7
3.7
7
100
0
52
76
0
0
23
0.78
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124
2.7
125
94
1
597
29
14
22
32
1.94
88101692--88101716
10
2.5
10
100
0
50
48
0
8
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1.32
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150
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34
1.68
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26
2.2
26
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107
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7
7
24
1.47
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28
0
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1.54
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3.4
113
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554
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0
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1.55
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27
0
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1.55
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1.9
25
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38
16
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40
1.67
88102489--88102541
24
2.2
24
89
0
79
1
24
32
41
1.66

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322