Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  102  of  318  ( 38109 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.7
26
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1
1
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1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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2
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0
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1
25
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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0
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0
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20
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1.80
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27
2.0
26
88
3
77
26
5
7
59
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33318753--33318803
16
3.4
16
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33
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35
1.75
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2.1
29
100
0
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23
21
1.97
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7
9.0
7
77
3
56
23
3
26
46
1.67
33328310--33328360
15
3.5
15
81
2
59
21
1
29
47
1.62
33328881--33328935
8
7.4
8
78
15
55
67
1
1
29
1.11
33328881--33328942
15
4.2
15
81
4
63
64
1
1
32
1.13
33329006--33329043
18
2.2
16
90
9
58
73
0
2
23
0.95
33328981--33329037
25
2.2
25
81
3
60
71
1
5
21
1.14
33333504--33333544
19
2.2
19
86
4
57
21
2
4
70
1.18
33333796--33333987
43
4.3
43
84
6
240
22
21
29
27
1.99
33339422--33339583
43
3.8
43
82
4
170
28
16
24
30
1.97
33348268--33348301
16
2.1
16
89
10
52
32
0
0
67
0.91
33349735--33349824
41
2.5
33
72
24
90
48
11
6
33
1.65
33349747--33349829
41
2.0
41
100
0
166
50
12
4
32
1.60
33351886--33351949
31
2.1
31
100
0
128
25
9
15
50
1.74
33355005--33355054
10
5.0
10
76
13
50
24
8
2
66
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33358859--33358898
17
2.3
18
95
4
73
40
10
15
35
1.80
33361314--33361374
10
6.0
10
84
7
79
22
8
0
68
1.15
33367103--33367162
28
2.1
28
100
0
120
35
30
10
25
1.88
33370976--33371063
7
12.7
7
92
2
151
26
0
0
73
0.83
33370977--33371105
7
19.5
6
81
15
84
24
0
0
74
0.87
33370985--33371109
14
8.6
14
79
13
94
24
0
0
75
0.86
33370978--33371109
21
6.1
21
81
13
110
24
0
0
75
0.86
33372493--33372723
100
2.3
98
82
3
284
28
27
19
24
1.99
33372493--33372723
49
4.7
49
80
3
284
28
27
19
24
1.99
33372942--33372995
27
2.0
27
85
0
72
38
12
7
40
1.72
33374198--33374240
22
2.0
22
85
0
59
32
41
11
13
1.81
33374552--33374585
11
2.9
12
86
8
52
5
14
23
55
1.61
33376064--33376121
26
2.3
26
82
8
68
68
5
0
25
1.10
33376103--33376150
21
2.3
20
82
7
51
70
8
0
20
1.12
33376197--33376229
15
2.1
16
88
11
50
69
0
0
30
0.88
33376253--33376283
15
2.0
16
93
6
55
0
32
58
9
1.31
33376487--33376539
10
5.1
10
84
6
61
24
5
0
69
1.09
33376505--33376550
21
2.1
22
84
4
58
28
6
2
63
1.31
33377842--33377925
6
14.0
6
76
14
68
19
3
1
76
1.00
33377848--33377902
28
2.0
27
85
7
74
18
3
1
76
1.02
33390040--33390226
96
2.0
95
85
1
257
29
12
25
32
1.93
33390878--33390925
10
4.8
10
92
0
69
22
10
2
64
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33391132--33391212
39
2.2
38
88
6
121
24
16
3
55
1.57
33395764--33395794
14
2.2
14
100
0
62
80
0
0
19
0.71
33397570--33397605
7
5.6
7
84
15
51
30
11
0
58
1.33
33407458--33407490
18
1.9
18
88
11
52
54
0
0
45
0.99
33408821--33408863
3
14.7
3
82
4
52
2
34
0
62
1.08
33408822--33408859
20
1.9
20
88
0
58
2
36
0
60
1.11
33411093--33411134
21
2.0
21
100
0
84
38
9
28
23
1.86
33413950--33413988
18
2.2
18
95
0
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51
2
0
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1.14
33413982--33414075
47
2.0
47
100
0
188
34
6
6
53
1.52
33415173--33415213
19
2.2
19
86
0
55
36
9
17
36
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318