Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  311  of  318  ( 38109 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
90
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1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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23
23
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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(0-2)
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2.7
260
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20
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14
2.5
16
83
8
53
60
2
0
36
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98388985--98389013
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0
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17
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88
0
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8
0.62
98406178--98406239
27
2.3
26
76
13
63
38
1
11
48
1.49
98406235--98406266
10
3.3
10
95
4
57
31
6
0
62
1.20
98407319--98407375
23
2.6
21
83
5
69
15
12
22
49
1.78
98413738--98413770
6
5.3
6
96
3
57
81
0
3
15
0.80
98422087--98422170
41
2.0
41
97
0
159
39
17
9
33
1.82
98422493--98422533
18
2.3
18
100
0
82
51
4
7
36
1.51
98423291--98423352
30
2.0
30
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12
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1
3
62
1.20
98430791--98430909
3
38.3
3
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1
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1.22
98430800--98430914
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3
2
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1.26
98431310--98431371
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2.1
29
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14
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40
1
0
58
1.08
98435068--98435096
13
2.1
14
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6
51
41
6
3
48
1.47
98443232--98443987
205
3.7
205
92
0
1208
31
18
21
28
1.97
98443236--98443987
411
1.8
411
90
1
1229
31
18
21
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98445616--98445744
7
18.1
7
73
17
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33
3
3
60
1.28
98445618--98445666
15
3.2
16
86
13
68
36
0
0
63
0.95
98445609--98445678
19
3.8
18
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14
72
32
1
1
64
1.11
98446148--98446203
17
3.2
18
78
14
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35
1
0
62
1.06
98446137--98446209
17
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16
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38
1
0
60
1.06
98446146--98446209
31
2.1
31
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1
0
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1.07
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2.0
19
100
0
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5
0
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2.3
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1
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1.19
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2.0
97
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0
302
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3
2
47
1.31
98467479--98467510
13
2.3
15
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10
50
62
0
9
28
1.26
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3
100
0
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0
0
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2.0
26
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0
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1.74
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60
0
3
35
1.20
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11
3.0
12
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12
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32
0
0
67
0.91
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7
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20
1.61
98474320--98474366
18
2.6
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2
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1.29
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141
1.9
141
88
1
402
18
18
8
54
1.68
98482373--98482412
19
2.1
19
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0
71
32
25
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32
1.89
98493553--98493610
5
10.8
5
80
12
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43
0
1
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1.10
98493554--98493611
8
6.7
9
74
21
61
43
0
1
55
1.10
98493556--98493611
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3.4
17
85
9
71
42
0
1
55
1.10
98494932--98494970
18
2.1
19
90
4
62
41
0
10
48
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98495208--98495308
38
2.5
41
72
15
104
23
18
28
28
1.98
98495467--98495507
19
2.2
19
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12
59
46
0
24
29
1.53
98504285--98504343
25
2.4
25
88
2
84
32
11
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7
17.1
7
68
9
68
36
39
0
22
1.60
98505713--98505810
7
13.4
7
72
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46
25
1
26
1.59
98505718--98505802
21
3.9
21
77
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44
27
1
27
1.62
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46
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0
179
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2
28
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100
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386
28
20
17
34
1.95
98518528--98518593
21
3.0
22
74
14
64
45
4
1
48
1.32

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318