Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  12  of  318  ( 38109 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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56
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1.99
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Indels
Score
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Entropy
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22
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21
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28
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1.8
93
92
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290
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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2.2
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0
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68
0
13
17
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4578533--4578566
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37
97
0
372
39
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20
25
1.90
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200
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2.1
14
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53
54
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1.42
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16
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1
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20
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0
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26
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4616529--4616573
19
2.4
19
78
10
56
24
6
0
68
1.13
4616537--4616581
19
2.3
20
88
7
67
31
4
0
64
1.13
4622598--4622626
6
4.8
6
100
0
58
34
13
51
0
1.42
4632483--4632601
58
2.0
59
95
1
213
47
10
9
32
1.69
4646166--4646212
23
2.0
24
83
4
60
63
6
8
21
1.44
4646655--4646726
20
3.3
20
65
20
54
52
8
2
36
1.46
4646645--4646736
46
2.0
46
100
0
184
50
8
2
39
1.46
4655064--4655290
96
2.4
91
82
7
242
43
2
16
37
1.60
4655335--4655872
126
4.3
126
90
1
812
33
18
21
26
1.96
4655327--4655872
251
2.2
251
89
2
819
33
18
21
27
1.96
4658161--4658212
11
4.9
11
79
9
63
42
0
26
30
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4658161--4658211
20
2.5
20
87
6
66
41
0
27
31
1.56
4658161--4658224
31
2.1
31
82
5
76
42
0
25
32
1.55
4698690--4699151
111
4.1
111
87
3
611
22
27
21
27
1.99
4705044--4705103
31
2.0
31
83
6
79
58
11
5
25
1.53
4713890--4713947
29
2.0
29
96
0
107
43
12
20
24
1.86
4720251--4720483
114
2.0
114
94
0
403
28
23
9
38
1.85
4723151--4723187
17
2.2
17
90
0
56
29
13
5
51
1.63
4726952--4726981
14
2.1
14
93
0
51
46
36
0
16
1.47
4729775--4729850
31
2.4
31
82
6
91
60
3
0
35
1.15
4729781--4729840
23
2.7
23
71
16
56
63
1
0
35
1.05
4731395--4731476
26
3.2
26
63
16
71
17
20
29
32
1.95
4731410--4731489
25
3.2
25
63
16
65
16
25
27
31
1.96
4731381--4731673
50
5.7
51
88
3
342
19
28
24
26
1.99
4731421--4731501
25
3.2
25
63
16
67
18
27
27
27
1.98
4731768--4731799
13
2.5
13
94
0
55
56
12
0
31
1.37
4732011--4732068
30
1.9
30
89
0
89
31
24
3
41
1.71
4733097--4733322
37
5.9
37
85
8
294
25
21
15
37
1.93
4733093--4733275
74
2.5
74
96
1
334
24
21
16
37
1.94
4733238--4733507
46
5.6
46
84
10
342
28
22
14
35
1.93
4733282--4733501
52
4.3
52
85
8
299
27
22
14
35
1.93
4733238--4733507
98
2.7
98
93
0
459
28
22
14
35
1.93
4739846--4740006
44
3.5
44
82
11
214
33
13
20
32
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4739853--4740009
51
3.2
49
81
12
198
34
12
21
31
1.91
4741489--4741532
15
3.0
15
83
6
63
54
4
0
40
1.21
4745065--4745103
2
19.5
2
100
0
78
51
0
48
0
1.00
4747348--4747378
16
1.9
16
93
0
53
29
12
3
54
1.53
4748390--4748423
18
1.9
18
88
5
52
47
11
0
41
1.40
4769417--4769450
18
1.9
18
88
5
52
55
26
5
11
1.58
4770120--4770273
43
3.6
43
92
0
263
29
33
25
11
1.91
4773666--4773733
16
4.1
16
80
3
64
64
0
13
22
1.27
4773666--4773748
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27
75
13
82
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0
14
19
1.25
4774290--4774354
27
2.5
26
79
20
75
60
0
12
27
1.33

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318