Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  64  of  318  ( 38109 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
22756480--22756528
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Period
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Indels
Score
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1.68
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Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
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452
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21
14
35
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22881054--22881087
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20
16
1.94
22899977--22900028
23
2.3
23
89
0
77
36
30
17
15
1.91
22899939--22900062
62
2.0
61
84
4
160
36
31
17
14
1.90
22902787--22902850
33
1.9
33
81
6
76
28
23
29
18
1.98
22902973--22903092
46
2.6
46
82
2
134
45
14
22
18
1.85
22903180--22903222
13
3.3
13
76
0
50
34
2
25
37
1.69
22903180--22903261
26
3.1
26
76
15
71
39
4
20
35
1.74
22910655--22910824
46
3.6
46
82
10
188
28
18
30
22
1.97
22913986--22914020
3
11.7
3
100
0
70
34
0
0
65
0.93
22915917--22915962
22
2.1
22
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0
56
50
0
0
50
1.00
22915976--22916011
16
2.2
16
90
0
54
63
0
0
36
0.94
22916559--22916609
19
2.6
21
78
15
63
52
1
0
45
1.12
22916559--22916604
20
2.3
20
85
14
60
56
2
0
41
1.11
22921507--22921591
44
1.9
44
97
0
161
40
14
5
40
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22922669--22922698
5
6.0
5
96
0
51
0
16
0
83
0.65
22931972--22932070
51
1.9
51
95
0
180
44
10
9
36
1.70
22933292--22933333
21
2.0
21
81
9
50
40
4
7
47
1.52
22953915--22953952
13
2.8
14
84
8
60
0
21
0
78
0.74
22954046--22954098
23
2.4
22
78
12
56
41
3
1
52
1.30
22955972--22956410
222
2.0
222
98
0
851
28
20
15
35
1.93
22959886--22959925
21
1.9
21
84
0
53
32
5
5
57
1.42
22967338--22967362
11
2.3
11
100
0
50
48
0
0
52
1.00
22972076--22972111
17
2.1
18
89
5
56
72
8
16
2
1.21
22974195--22974236
14
3.1
14
82
3
50
76
11
4
7
1.15
22975761--22975861
52
1.9
52
100
0
202
58
7
7
25
1.54
22979556--22979588
17
2.0
17
94
5
59
36
15
0
48
1.45
22979874--22980193
46
7.0
46
92
1
405
22
23
14
40
1.91
22979874--22980193
138
2.3
138
88
1
453
22
23
14
40
1.91
22979874--22980193
92
3.5
92
89
1
455
22
23
14
40
1.91
22983549--22983616
36
1.9
35
82
8
84
55
1
5
36
1.33
22983584--22983661
10
7.8
10
74
7
52
64
1
3
30
1.20
22983515--22983656
76
1.9
75
79
8
162
62
1
4
31
1.23
22983829--22983884
20
2.8
19
86
7
69
28
1
7
62
1.32
22983884--22983944
30
2.1
29
87
3
86
36
0
0
63
0.94
22983894--22983960
30
2.3
30
84
7
84
37
1
1
59
1.16
22985017--22985089
3
25.7
3
77
10
73
67
1
28
2
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22985015--22985083
14
4.9
14
78
7
77
68
1
27
2
1.13
22985020--22985089
11
6.5
11
73
15
56
67
1
28
2
1.14
22985017--22985089
22
3.2
22
79
9
85
67
1
28
2
1.13
22986662--22986699
20
2.0
20
94
5
69
55
5
2
36
1.37
22986666--22986720
20
2.8
20
84
10
62
58
3
3
34
1.33
22986661--22986723
19
3.5
17
74
20
58
58
3
3
34
1.30
22986704--22986801
19
4.8
20
71
21
71
58
8
2
31
1.39
22986877--22986910
14
2.3
15
90
5
52
55
0
8
35
1.31
22987345--22987481
3
45.0
3
67
16
50
61
3
3
31
1.31
22987339--22987481
22
6.4
22
69
18
73
60
4
3
31
1.32

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318