Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  301  of  318  ( 38109 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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2
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1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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136
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32
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95828263--95828651
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1.40
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10.3
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2
2
30
1.21
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100
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0
0
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0
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0.98
95842679--95842745
32
2.1
32
83
8
84
35
10
13
40
1.79
95843283--95843398
58
2.0
57
93
1
196
51
12
5
30
1.62
95852291--95852339
23
2.1
23
82
14
57
34
6
2
57
1.35
95852940--95852993
27
2.0
28
82
7
67
33
3
3
59
1.33
95853042--95853098
27
2.0
27
83
6
69
57
3
0
38
1.16
95859315--95859342
12
2.3
12
100
0
56
71
0
7
21
1.09
95859541--95859578
18
2.1
19
90
5
60
68
0
31
0
0.90
95859558--95859659
44
2.1
50
82
13
126
59
1
37
0
1.15
95860396--95860434
19
2.1
19
85
9
53
30
2
0
66
1.05
95860211--95860661
212
2.1
212
94
0
787
39
10
6
43
1.64
95861089--95861158
32
2.2
31
82
5
77
70
2
10
17
1.28
95861121--95861166
17
2.8
16
87
6
65
71
2
10
15
1.23
95861121--95861202
33
2.6
32
74
18
82
70
4
8
15
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95861098--95861166
16
4.2
16
76
10
68
66
2
10
20
1.34
95861163--95861209
25
1.9
24
91
4
76
65
6
6
21
1.38
95861178--95861514
137
2.5
136
90
2
532
57
6
7
28
1.51
95862485--95862573
44
2.0
44
97
0
169
30
16
24
28
1.97
95864407--95864485
41
1.9
41
82
5
97
11
24
32
31
1.90
95866943--95867094
63
2.4
64
97
1
288
46
11
3
38
1.58
95870294--95870349
27
2.1
27
86
0
76
28
28
30
12
1.93
95874736--95874761
5
5.2
5
100
0
52
19
0
0
80
0.71
95875357--95875402
23
2.0
24
91
4
76
32
2
0
65
1.05
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21
2.0
21
86
0
59
30
6
4
58
1.45
95883599--95883820
40
5.6
39
81
5
205
25
27
21
25
1.99
95883597--95883768
79
2.2
79
83
5
213
26
27
20
25
1.99
95887052--95887106
27
2.0
27
89
0
83
40
27
25
7
1.82
95887375--95887441
28
2.3
30
82
7
75
46
4
20
28
1.70
95889403--95889433
15
2.1
15
100
0
62
29
6
25
38
1.81
95892107--95892153
21
2.3
20
80
20
53
70
6
4
19
1.26
95892720--95892766
22
2.2
21
88
3
67
36
19
8
36
1.82
95892737--95892796
17
3.2
19
86
13
88
35
16
10
38
1.82
95893149--95893177
7
4.1
7
100
0
58
86
0
13
0
0.58
95893623--95893653
16
1.9
16
100
0
62
45
16
38
0
1.47
95901350--95901415
31
2.1
31
88
0
96
33
12
15
39
1.84
95908771--95908863
40
2.3
41
82
10
104
30
16
24
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95914469--95914534
31
2.2
31
86
2
89
45
4
4
45
1.44
95919668--95919726
20
2.9
21
80
12
61
38
1
0
59
1.08
95919681--95919733
10
4.7
11
80
17
56
41
1
0
56
1.10
95919688--95919726
20
2.0
20
90
10
62
43
0
0
56
0.99
95919690--95919739
24
2.0
24
96
3
91
46
0
0
54
1.00
95920841--95920886
22
2.1
22
84
8
58
52
0
2
45
1.13
95920869--95920943
18
4.0
20
66
22
54
49
0
1
49
1.09
95922995--95923030
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19
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58
2
0
38
1.13
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20
1.9
20
89
5
60
64
5
0
30
1.15
95923143--95923245
14
6.9
14
72
15
55
64
2
1
31
1.19

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318