Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  78  of  318  ( 38109 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26731166--26731218
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26731166--26731218
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3.1
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13
52
67
0
3
28
1.07
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2
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2
2
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1.22
26731429--26731577
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7.4
19
70
19
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2
0
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2.0
203
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2.5
125
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2.0
18
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2.2
22
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50
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2.0
29
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2.1
87
97
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20
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1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
16
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3
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2.3
22
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23
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57
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1.30
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25
2.7
26
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2
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37
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.7
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4
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2
7
37
1.44
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28.3
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70
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3
2
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1.27
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2.5
22
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63
0
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1.24
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2.3
63
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1
232
30
28
13
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1.94
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178
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21
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1.94
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7.3
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20
15
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31
21
15
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92
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2
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4
50
1.39
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3.2
16
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5
97
24
0
37
37
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26901068--26901158
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0
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0
45
0.99
26925723--26925795
27
2.7
27
76
8
76
52
2
0
45
1.15
26925869--26925935
26
2.6
25
71
17
66
53
2
0
43
1.16
26925690--26926106
125
3.0
142
80
13
378
47
5
2
44
1.38
26926105--26926151
17
2.9
16
78
18
53
46
2
6
44
1.40
26926124--26926157
17
2.0
17
94
0
59
50
0
5
44
1.26
26926190--26926383
92
2.1
91
88
5
284
46
4
4
44
1.41
26927783--26927809
11
2.5
11
100
0
54
51
18
7
22
1.70
26944230--26944275
21
2.2
21
84
0
56
43
21
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28
1.77
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3
11.3
3
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0
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0
2
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1.08
26946213--26946248
18
2.0
18
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10
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36
0
5
58
1.22
26947198--26947254
24
2.3
26
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11
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33
7
3
56
1.43
26960519--26960702
94
2.0
94
93
0
314
29
18
16
35
1.93
26965642--26965731
23
3.9
23
71
8
67
20
21
17
41
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26966616--26966696
42
1.9
42
94
0
144
34
19
17
28
1.95
26970684--26970799
40
2.9
39
81
8
117
39
9
15
35
1.80
26978319--26978602
36
7.7
36
70
13
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36
15
12
34
1.86
26978412--26978614
18
11.3
18
73
12
157
37
14
11
35
1.83
26978739--26978847
47
2.3
47
90
3
166
37
23
22
15
1.93
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12
2.1
12
100
0
50
40
20
24
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1.91
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20
2.4
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10
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32
6
0
61
1.21
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2.0
42
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0
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27
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3
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1.60
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2
2
77
0.99
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5
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15
4
0
80
0.87
26984977--26985021
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4.3
10
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15
4
0
80
0.87
26984977--26985021
16
2.9
15
80
9
54
15
4
0
80
0.87
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2.6
13
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4
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60
2
0
37
1.12
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2
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2
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0
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0
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1.00
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22
1.97
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2.3
18
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33
0
0
66
0.92
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2
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0
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50
0
0
50
1.00
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18
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13
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0
7
36
1.28
27031044--27031110
35
1.9
35
96
0
125
56
0
7
35
1.27
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21
2.1
21
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8
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47
9
0
43
1.35
27032970--27033011
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16
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0
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33
0
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1.58
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18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27033390--27033431
15
2.7
16
82
14
52
52
2
0
45
1.13
27033143--27033440
154
1.9
156
95
2
537
44
3
5
47
1.40
27033399--27033533
15
8.9
15
67
24
70
51
3
2
42
1.32
27033182--27033497
154
2.0
155
83
7
401
46
4
3
45
1.39
27033459--27033549
44
2.1
43
81
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103
53
3
2
40
1.29
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120
1.8
119
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345
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5
3
40
1.44
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51
0
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0
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286
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4
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44
1.41
27035284--27035310
11
2.5
11
100
0
54
51
18
7
22
1.70

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318