Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  18  of  318  ( 38109 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6981993--6982023
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2.2
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0
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2.4
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3.2
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126
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0
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19
20
24
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
127
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0
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0
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11
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1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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233
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4
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1.47
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22
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1.97
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25
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2
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26
27
22
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1.99
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0
0
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2.4
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0
197
27
24
11
36
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7175180--7175227
11
4.2
11
79
10
51
62
2
0
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1.07
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0
0
50
1.00
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0
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0
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13
2.0
13
100
0
52
61
0
0
38
0.96
7191824--7191860
19
1.9
19
88
0
56
67
2
2
27
1.17
7199708--7199732
5
5.0
5
100
0
50
20
0
0
80
0.72
7199753--7199791
17
2.4
16
83
8
51
23
2
10
64
1.37
7200184--7200260
25
3.0
26
74
16
72
25
5
6
62
1.41
7200239--7200372
52
2.5
54
76
15
127
32
5
2
59
1.32
7202117--7202177
24
2.6
23
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7
77
34
0
0
65
0.93
7202400--7202441
3
14.0
3
85
9
59
69
0
30
0
0.89
7203087--7203136
26
2.0
24
88
7
73
64
6
0
30
1.18
7203107--7203165
21
2.8
21
78
12
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69
8
0
22
1.15
7208467--7208498
5
6.6
5
92
7
57
18
0
0
81
0.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7208467--7208497
9
3.3
9
91
8
53
19
0
0
80
0.71
7209496--7209550
22
2.7
20
84
13
76
63
0
0
36
0.95
7214345--7214388
22
2.0
22
90
0
70
47
6
6
38
1.57
7214348--7214397
22
2.3
22
79
6
57
52
10
6
32
1.59
7232621--7232673
20
2.7
20
80
13
65
33
3
0
62
1.13
7242988--7243029
21
2.0
21
100
0
84
9
14
23
52
1.71
7248135--7248163
12
2.3
13
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5
51
3
27
0
68
1.05
7267372--7267401
14
2.1
14
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0
51
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0
10
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35
2.2
35
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109
48
6
9
35
1.62
7271920--7271960
21
2.0
21
85
0
55
21
29
19
29
1.98
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28
2.0
30
84
12
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40
1
3
54
1.27
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44
2.3
45
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3
127
30
21
13
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1.92
7290570--7290655
46
1.9
44
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4
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29
24
13
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1.94
7296592--7296652
32
1.9
32
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0
95
47
1
9
40
1.46
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11
3.7
11
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0
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0
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1.02
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2.0
31
93
0
104
37
1
6
54
1.37
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60
1.9
59
87
5
169
45
5
6
43
1.51
7336917--7336942
12
2.2
12
100
0
52
42
0
0
57
0.98
7338342--7338387
12
3.6
12
78
16
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34
0
0
65
0.93
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19
2.3
20
84
7
56
27
20
11
40
1.86
7343274--7343302
8
3.6
8
100
0
58
72
13
0
13
1.13
7345449--7345675
44
5.2
44
64
10
140
28
23
22
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7345445--7345872
88
4.9
88
89
2
555
29
22
22
25
1.99
7345487--7345620
43
3.1
41
62
22
94
27
20
24
27
1.99
7345493--7345719
44
5.2
44
65
12
160
27
21
23
27
1.99
7346021--7346126
44
2.4
44
80
7
126
29
23
23
23
1.99
7346007--7346161
43
3.6
43
75
6
152
29
21
21
27
1.98
7347873--7347918
12
3.6
12
78
16
56
34
0
0
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0.93
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2.0
28
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10
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3
0
28
1.07
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1.9
21
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10
64
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15
0
17
1.23
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13
100
0
52
7
7
7
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1.15
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24
2.0
24
100
0
96
54
4
12
29
1.56

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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