Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  19  of  318  ( 38109 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.4
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5
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1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
30
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20
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1
3
66
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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9
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20
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1.93
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3.1
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1
438
35
14
22
28
1.93
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22
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1.93
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1.93
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1.93
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1.93
7564351--7564712
150
2.4
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34
14
21
28
1.93
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509
35
14
22
28
1.93
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37
6.0
37
95
1
381
37
16
21
24
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7587189--7587213
12
2.1
12
100
0
50
52
24
8
16
1.70
7590140--7590172
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2.6
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4
50
63
3
0
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1.10
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2.8
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17
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1
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0
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3
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0
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1
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0
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0.79
7608839--7608879
16
2.6
15
84
3
55
4
7
2
85
0.81
7610310--7610613
87
3.4
87
88
11
463
34
19
19
25
1.96
7610400--7610594
97
2.0
95
94
3
338
34
21
18
25
1.96
7616619--7616919
46
6.7
46
87
6
404
37
14
24
22
1.92
7616570--7616875
84
3.5
84
92
3
477
36
15
25
23
1.94
7617180--7617226
25
2.0
25
83
8
62
53
4
14
27
1.60
7626373--7626418
22
2.2
21
88
7
67
54
8
4
32
1.51
7627109--7627170
22
2.7
22
77
7
61
66
3
3
27
1.23
7627363--7627419
28
2.1
28
90
3
89
57
5
0
36
1.21
7627544--7627616
23
3.4
22
77
9
71
56
1
5
36
1.31
7627550--7627619
21
3.0
22
80
17
72
58
1
5
34
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7630725--7630829
26
4.0
26
87
4
158
35
20
8
35
1.84
7634626--7634665
21
2.0
20
85
5
53
17
45
20
17
1.86
7635698--7635728
12
2.6
12
94
0
53
16
48
25
9
1.76
7638936--7639040
26
4.0
26
93
0
183
35
23
8
32
1.85
7639460--7639506
15
3.4
14
85
8
60
10
6
2
80
0.96
7646282--7646332
18
3.1
16
76
17
59
58
3
0
37
1.16
7646300--7646330
9
3.4
9
95
0
53
61
6
0
32
1.21
7658522--7658554
13
2.5
13
85
14
50
39
0
27
33
1.57
7665792--7665829
15
2.5
15
84
12
51
42
0
44
13
1.43
7665822--7665902
3
27.0
3
80
5
92
59
0
38
2
1.11
7670233--7670281
21
2.3
21
86
6
73
2
24
10
63
1.37
7693253--7693379
63
2.0
63
87
3
184
29
24
14
30
1.95
7696552--7696594
22
2.0
22
85
0
59
58
11
11
18
1.63
7696559--7696599
11
3.7
11
80
0
55
56
9
14
19
1.66
7696560--7696609
22
2.3
22
86
6
66
60
6
16
18
1.55
7701699--7701967
46
5.6
46
89
5
340
34
14
21
29
1.93
7701759--7701956
52
3.9
52
88
5
291
34
14
21
28
1.93
7701931--7702077
37
4.0
37
94
0
242
37
14
21
26
1.92
7704603--7704873
18
14.6
18
70
16
169
36
16
12
34
1.86
7704684--7704885
72
2.8
71
81
5
228
36
15
12
35
1.86
7705049--7705073
6
4.2
6
100
0
50
52
16
16
16
1.76
7705053--7705157
45
2.3
45
88
0
156
40
20
20
19
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7705415--7705455
5
8.0
5
89
5
64
41
17
0
41
1.49
7705809--7705869
21
2.9
21
79
13
63
47
18
0
34
1.49
7707025--7707093
27
2.4
28
79
15
79
39
36
5
18
1.75
7707705--7707735
12
2.6
12
94
0
53
0
25
0
74
0.82
7707815--7707845
16
1.9
16
93
0
53
54
3
0
41
1.16
7710371--7710423
27
2.0
27
92
0
88
30
11
28
30
1.91
7717903--7717968
24
2.7
23
84
13
71
51
15
1
31
1.52
7721701--7721730
9
3.2
9
95
4
51
66
0
0
33
0.92
7721703--7721733
10
3.2
10
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4
55
64
0
0
35
0.94
7722704--7722729
12
2.2
12
100
0
52
73
0
0
26
0.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318