Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  58  of  318  ( 38109 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20763568--20763608
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0
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7.2
15
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12
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7
21
26
1.78
20793874--20793997
30
4.1
30
91
1
194
43
6
23
26
1.78
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2
0
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0
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5
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2
1
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1.9
20
89
5
60
66
2
0
30
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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21
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2.3
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0
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1.22
20854743--20854810
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2.0
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37
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4.3
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22
14
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20879249--20879517
98
2.7
98
93
0
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15
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13
76
18
51
56
0
2
41
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20890966--20891007
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18
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0
55
1.12
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1.10
20908258--20908328
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19
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1.21
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1.90
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2.3
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37
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0
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1.37
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23
2.5
23
80
11
71
50
0
8
41
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20970580--20970612
12
2.5
13
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51
0
0
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1.00
20975623--20975662
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2.0
20
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35
25
15
25
1.94
20979596--20979622
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1.9
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2
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1.36
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1.34
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8
5
23
1.45
21025432--21025526
41
2.3
43
83
3
122
61
8
4
26
1.43
21025432--21025527
43
2.3
43
80
8
108
61
8
4
26
1.43
21028993--21029019
6
4.5
6
100
0
54
33
0
66
0
0.92
21036131--21036323
90
2.2
90
88
2
282
30
30
7
31
1.86
21041476--21041509
16
2.1
16
88
0
50
26
0
2
70
1.01
21042023--21042082
27
2.2
28
77
19
65
15
5
8
71
1.27
21053357--21053532
46
3.8
46
75
12
180
21
18
29
30
1.97
21053354--21053524
93
1.8
93
89
0
270
21
19
29
29
1.97
21053680--21053729
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24
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0
100
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26
30
1.85
21056186--21056221
17
2.2
16
90
5
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11
5
13
69
1.34
21063578--21063604
12
2.2
12
100
0
54
37
48
14
0
1.45
21065961--21066102
74
1.9
74
94
2
250
54
10
12
22
1.68
21069155--21069211
29
2.0
29
96
0
105
42
10
14
33
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21081198--21081228
13
2.4
13
100
0
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41
9
16
32
1.80
21082030--21082083
14
3.9
13
83
9
63
42
0
12
44
1.43
21082288--21082316
14
2.0
15
93
6
51
75
0
0
24
0.80
21084315--21084355
21
2.0
21
100
0
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36
14
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29
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11
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11
100
0
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22
7
18
51
1.70
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92
2.1
92
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5
286
44
4
4
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1.41
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2.0
52
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11
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6
2
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17
2.0
17
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5
0
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6
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45
1.40
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0
0
52
1.00
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2.0
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0
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0
0
54
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1.9
147
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4
478
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2
3
46
1.34
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2.0
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0
0
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1.79
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2.1
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1.58
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16
2.1
16
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0
57
33
0
36
30
1.58
21095704--21095798
45
2.1
44
88
1
136
34
5
27
32
1.79
21095960--21095994
18
2.0
17
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0
0
45
0.99
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27
2.7
27
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8
76
52
2
0
45
1.15
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17
2.5
17
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14
52
54
0
0
45
0.99
21096103--21096137
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21095879--21096149
143
1.9
147
93
4
478
46
3
2
46
1.34
21096303--21096349
17
2.9
16
78
18
53
46
2
6
44
1.40
21096322--21096355
17
2.0
17
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0
59
50
0
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2.1
91
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284
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4
4
44
1.41
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2.5
11
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0
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22
1.70
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0
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0
0.65
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2
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0
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1.91
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2.0
35
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0
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23
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1.96
21118975--21119138
81
2.0
81
93
0
283
22
22
18
36
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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