Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  251  of  318  ( 38109 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Indices
Period
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Copy
Number
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Score
A
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1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
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A
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(0-2)
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5
1
67
1.21
80076183--80076236
23
2.3
22
87
9
72
16
5
0
77
0.94
80076183--80076230
12
4.0
12
76
17
55
16
4
0
79
0.89
80078935--80079146
94
2.3
91
81
11
227
27
17
28
25
1.98
80079027--80079146
46
2.7
44
83
8
143
25
19
30
25
1.98
80086046--80086215
46
3.7
46
77
7
173
27
19
30
22
1.98
80089718--80089786
11
5.9
11
70
18
50
75
1
18
4
1.05
80089726--80089785
31
1.9
31
86
6
86
75
0
20
5
0.99
80098682--80098714
13
2.6
13
95
4
59
45
12
0
42
1.41
80106720--80106752
13
2.6
13
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4
50
48
12
0
39
1.40
80110737--80110763
13
2.1
13
100
0
54
22
33
29
14
1.94
80122922--80123001
39
2.1
39
100
0
160
31
23
5
40
1.76
80131245--80131339
25
3.8
25
81
5
111
35
18
23
22
1.96
80133331--80133377
10
4.6
10
80
12
51
31
0
2
65
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80134354--80134397
21
2.1
21
100
0
88
52
0
13
34
1.41
80141606--80141689
25
3.4
25
85
4
91
32
21
21
25
1.98
80141619--80141696
25
3.2
25
85
1
95
34
19
23
23
1.96
80145691--80145760
34
2.1
34
100
0
140
37
14
2
45
1.59
80145696--80145754
20
3.2
20
65
34
60
38
13
3
44
1.61
80145915--80145949
18
1.9
18
88
11
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34
0
8
57
1.29
80147241--80147310
31
2.3
31
85
5
88
35
11
0
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1.37
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30
1.9
30
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0
105
19
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29
14
1.91
80164416--80164536
42
2.8
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131
32
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18
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1.97
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2.0
19
100
0
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26
10
15
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1.78
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2.1
71
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1
240
27
14
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1.88
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21
2.4
21
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3
75
36
26
16
22
1.94
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16
2.1
16
94
0
59
0
26
0
73
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21
2.0
21
85
0
57
40
21
0
38
1.53
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26
2.4
24
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10
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67
3
0
28
1.06
80198195--80198253
21
2.8
22
85
7
70
69
6
0
23
1.12
80198300--80198332
15
2.1
16
88
11
50
69
0
0
30
0.88
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21
2.5
21
90
0
88
26
7
35
30
1.84
80203698--80203749
14
3.6
15
71
10
54
46
0
5
48
1.26
80213194--80213505
161
2.0
158
87
5
459
39
11
5
43
1.65
80215478--80216188
354
2.0
354
97
0
1332
34
18
19
28
1.95
80216154--80217085
44
21.2
44
86
2
1210
28
15
30
26
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80218551--80218641
44
2.1
44
97
0
173
26
7
8
57
1.56
80219017--80219076
25
2.3
26
91
2
95
23
3
6
66
1.30
80219163--80219207
22
2.0
22
86
0
63
26
4
2
66
1.22
80239843--80239883
13
3.2
13
86
6
57
36
4
2
56
1.34
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24
1.9
24
100
0
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34
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1.71
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2.0
25
100
0
102
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46
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204
23
28
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1.9
13
100
0
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16
4
16
1.44
80250786--80250847
23
2.5
25
79
12
74
17
29
24
29
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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