Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  9  of  318  ( 38109 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3104227--3104293
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32
88
2
100
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3104285--3104350
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1.20
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2.1
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2.0
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2.3
22
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2.2
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2.0
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0
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50
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19
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28
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2.0
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2.3
33
79
2
89
30
8
24
37
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3166370--3166525
41
3.8
41
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226
28
19
22
28
1.98
3166739--3166801
33
1.9
32
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99
25
9
25
39
1.86
3166744--3166818
33
2.3
33
79
2
89
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8
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37
1.84
3168378--3168441
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2.0
32
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0
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4
50
39
0
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2.4
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1048
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4.5
43
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22
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14
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29
20
20
1.98
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1.8
93
93
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2
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13.8
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1
77
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6
20.2
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35
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50
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121
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151
87
4
813
58
7
6
28
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.9
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205
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25
20
1.95
3264472--3264721
101
2.4
101
79
10
276
35
18
25
21
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3264912--3264942
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1.9
16
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0
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21
1.00
3274118--3274163
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0
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0
0
34
0.93
3285063--3285104
15
2.8
15
85
0
57
26
19
4
50
1.67
3287443--3287480
18
2.1
18
100
0
76
36
0
10
52
1.36
3304440--3304500
14
4.8
12
75
15
52
34
3
1
60
1.23
3304440--3304500
26
2.3
26
76
15
63
34
3
1
60
1.23
3311249--3311383
39
3.4
39
74
11
116
28
27
20
23
1.99
3316117--3316382
103
2.6
104
91
0
426
19
20
30
29
1.97
3337622--3337652
16
1.9
16
100
0
62
19
0
9
70
1.14
3342035--3342081
21
2.2
22
84
3
60
48
2
10
38
1.50
3345215--3345266
21
2.3
23
72
21
56
50
1
3
44
1.31
3368310--3368338
13
2.1
14
93
6
51
27
0
0
72
0.85
3368745--3368788
22
2.0
22
82
13
54
36
9
0
54
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3369435--3369472
20
1.9
20
84
10
51
39
0
2
57
1.12
3374827--3374909
42
2.0
42
92
4
141
39
15
28
15
1.88
3380454--3380605
52
2.9
52
81
2
153
25
17
28
29
1.97
3384333--3384383
18
2.8
18
84
0
66
43
9
7
39
1.67
3385649--3385678
13
2.3
13
94
0
51
0
26
0
73
0.84
3385876--3385908
16
2.1
16
88
5
50
48
3
0
48
1.17
3386051--3386109
13
4.5
13
71
21
52
66
3
0
30
1.08
3390927--3390993
21
3.1
21
77
8
80
37
22
20
19
1.95
3390927--3390992
23
3.0
22
78
6
80
37
22
21
18
1.94
3391365--3391418
15
3.5
15
87
2
81
51
11
0
37
1.37
3396355--3396381
11
2.5
11
100
0
54
22
7
18
51
1.70
3397788--3397995
91
2.3
91
89
0
308
45
3
3
47
1.36
3397897--3397970
27
2.8
28
83
6
91
43
0
2
54
1.14
3397820--3397963
47
3.1
47
69
16
138
43
1
3
51
1.27
3397828--3397970
44
3.2
43
68
16
119
45
1
2
50
1.25
3398011--3398303
120
2.4
120
90
3
457
41
2
5
49
1.40
3398256--3398297
15
2.9
15
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10
52
50
0
0
50
1.00
3398240--3398554
155
2.0
157
95
1
571
47
5
3
44
1.41
3398407--3398441
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
3398602--3398696
45
2.1
44
90
1
145
34
27
5
32
1.79
3398677--3398728
16
3.2
16
94
0
86
34
36
0
28
1.58
3399669--3399714
23
2.0
23
87
4
67
45
8
6
39
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3399676--3399720
23
2.0
23
86
0
63
40
11
8
40
1.72
3402562--3402688
42
3.0
42
86
6
170
29
26
14
29
1.95
3402795--3402943
31
4.8
31
93
0
235
26
27
19
26
1.99
3402919--3403047
50
2.5
51
87
5
181
27
22
13
35
1.92
3406200--3406300
41
2.5
41
95
0
184
18
19
24
36
1.95
3409477--3409631
42
3.7
41
75
19
142
28
27
13
30
1.94
3409738--3409884
31
4.7
31
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3
242
26
27
19
25
1.99
3414456--3414500
23
1.9
24
90
4
74
13
8
33
44
1.75
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2.4
11
100
0
52
23
0
30
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1.53
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39
2.7
39
90
0
154
14
22
23
40
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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