Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  316  of  318  ( 38109 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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17
28
21
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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2.9
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1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
Size
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A
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(0-2)
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2
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2
4
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1.34
99964758--99964813
15
3.5
18
75
24
63
42
0
0
57
0.99
99964712--99964894
56
3.1
58
66
23
146
42
2
6
49
1.39
99964878--99964912
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
99964866--99965140
147
1.9
149
94
1
491
47
3
3
45
1.36
99965221--99965315
45
2.1
45
84
1
120
33
25
5
35
1.78
99965296--99965347
16
3.2
16
88
0
68
36
32
0
30
1.58
99970045--99970105
29
2.1
29
90
0
95
54
22
6
16
1.65
99976797--99976823
12
2.2
12
100
0
54
37
0
18
44
1.50
99980660--99980716
30
1.9
30
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38
8
24
28
1.85
99981140--99981314
47
3.8
45
79
15
196
21
19
28
30
1.98
99988235--99988311
24
3.2
24
66
14
59
27
12
7
51
1.67
99988221--99988320
48
2.1
48
94
0
173
25
12
10
53
1.68
99989017--99989112
48
2.0
48
93
0
165
54
9
10
26
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99990389--99990496
26
4.2
26
87
0
153
32
10
24
33
1.89
99995602--99995653
21
2.5
22
82
11
58
32
3
0
63
1.12
99996737--99996800
26
2.4
27
75
14
71
62
1
7
28
1.32
100000516--100000724
3
69.3
3
68
11
72
58
4
7
29
1.45
100000801--100000839
21
1.9
20
84
5
51
38
5
0
56
1.22
100015263--100015317
21
2.8
20
78
8
58
12
12
7
67
1.42
100015268--100015315
21
2.3
21
85
0
60
10
10
6
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1.26
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14
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14
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0
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0
10
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1.38
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27
2.5
27
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75
55
4
0
39
1.20
100016762--100016832
8
8.4
8
71
11
52
52
2
0
45
1.15
100016729--100016781
20
2.7
20
91
2
81
62
5
0
32
1.19
100016729--100016793
19
3.4
19
85
10
71
60
4
0
35
1.18
100017657--100017698
19
2.3
18
95
4
75
0
33
19
47
1.49
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18
2.9
18
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17
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50
0
5
43
1.25
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9
4.4
9
84
6
55
70
2
0
26
0.99
100035795--100035835
19
2.2
18
91
4
64
70
2
0
26
0.99
100057382--100057435
26
2.1
26
100
0
108
33
14
14
37
1.88
100057742--100057781
13
3.2
13
85
3
55
67
2
2
27
1.16
100059403--100059437
17
2.0
18
88
5
54
65
0
2
31
1.07
100068870--100068932
31
2.0
31
93
0
108
23
17
17
41
1.90
100072372--100072408
16
2.3
16
100
0
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5
5
16
1.21
100072924--100072974
23
2.2
23
96
0
93
23
50
19
5
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100075333--100075688
131
2.7
131
81
1
401
30
17
18
34
1.94
100086615--100086644
12
2.5
12
94
0
51
26
0
0
73
0.84
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30
2.0
30
87
0
86
57
11
4
26
1.54
100086858--100086900
22
2.0
22
86
9
61
58
13
9
18
1.62
100088448--100088477
15
2.0
15
93
0
51
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0
0
23
0.78
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25
3.9
25
70
14
67
67
2
1
29
1.09
100088446--100088532
40
2.2
38
77
18
97
67
1
1
29
1.05
100088448--100088554
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1
1
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1.12
100088697--100088743
15
3.1
15
84
0
67
40
0
4
55
1.19
100088885--100088924
21
1.9
21
89
0
62
37
32
12
17
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318