Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  243  of  318  ( 38109 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77156240--77156343
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1.97
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204
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0
2
62
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
12
40
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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22
0
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44
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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1.99
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2.2
18
85
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51
58
2
2
35
1.25
77330338--77330392
25
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23
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58
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3
16
36
1.65
77330448--77330522
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22
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10
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60
5
5
29
1.41
77330454--77330661
25
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25
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14
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4
6
31
1.43
77331147--77331270
30
4.3
30
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202
19
6
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24
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77331154--77331266
56
2.0
56
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0
208
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7
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23
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77332587--77332658
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13
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12
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1.76
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26
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77334104--77334137
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0
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0
1
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0.81
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14
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14
79
13
57
77
0
2
20
0.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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66
0
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10
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1
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1.25
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24
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1.98
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44
4.9
44
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12
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24
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1.98
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133
2.9
131
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26
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19
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1.97
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19
2.1
19
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0
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0
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44
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201
2.0
201
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0
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21
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2
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34
1.70
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26
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183
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1.37
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106
30
5
2
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1.31
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72
2.3
72
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28
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1.39
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15
2.0
15
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0
60
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0
0
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3.5
104
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10
423
47
11
1
39
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77388274--77388495
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1.9
115
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1
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1.51
77388193--77388618
205
2.1
203
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1
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12
1
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1.52
77388389--77388582
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2.2
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1.52
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43
4.0
42
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21
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1.96
77394677--77394844
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2.0
85
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2.9
19
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7
69
32
17
7
42
1.77

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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