Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  61  of  318  ( 38109 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21792170--21792426
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2.1
122
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13
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21822157--21822218
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2.0
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0
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0
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0
0
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2.5
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77
16
125
42
0
1
55
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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41
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2.2
20
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50
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2.4
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47
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2.2
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2.0
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29
1.98
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2.5
37
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98
27
29
22
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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76
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17
13
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53
51
0
0
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2
0
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13
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1.24
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21
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0
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1.20
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1
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0
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75
69
0
0
30
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21982512--21982564
27
1.9
28
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69
0
0
30
0.88
21982512--21982572
27
2.2
27
82
2
68
67
1
0
31
1.01
21982587--21982631
19
2.7
15
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37
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1.26
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1
1
45
1.19
21982824--21982887
22
2.9
22
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1
1
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4
0
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0.98
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1
178
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2
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1.30
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2
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2
2
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1.27
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34
2.8
33
78
9
88
56
2
3
38
1.27
21983178--21983229
14
3.7
14
78
14
54
80
0
7
11
0.89
21983687--21983781
27
3.4
28
72
20
90
47
18
15
17
1.83
21986038--21986145
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
21990744--21990960
46
4.7
46
84
1
220
20
19
13
46
1.83
21990744--21990921
46
3.9
46
86
0
223
18
19
14
47
1.83
21990749--21990960
91
2.3
92
82
0
255
19
19
13
47
1.82
21992754--21992809
11
5.2
11
78
4
60
64
1
0
33
1.04
21997132--21997173
22
1.9
22
85
9
59
26
2
23
47
1.64
21998966--21999011
20
2.3
20
85
7
58
21
17
8
52
1.71
22000531--22000571
13
3.2
13
89
6
66
2
0
29
68
1.03
22000531--22000571
6
6.7
6
88
5
64
2
0
29
68
1.03
22000614--22000711
43
2.3
42
86
10
128
42
15
9
32
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22002921--22003012
34
2.7
34
83
8
116
44
0
15
40
1.46
22003168--22003428
120
2.2
120
82
10
313
36
17
15
31
1.91
22014101--22014145
22
2.0
22
95
0
81
57
0
8
33
1.30
22014105--22014148
11
4.0
11
81
0
61
52
0
9
38
1.33
22014445--22014509
3
22.0
3
74
14
55
67
1
3
27
1.14
22014445--22014517
23
3.4
21
80
14
69
67
4
2
26
1.22
22016073--22016625
43
12.9
44
73
12
388
25
23
21
29
1.99
22016080--22016628
214
2.6
215
96
2
1009
26
22
21
29
1.99
22017829--22017863
6
5.7
6
96
3
61
14
14
0
71
1.15
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15
4.2
13
75
19
50
11
11
1
75
1.12
22018698--22018741
22
2.0
22
90
0
70
9
4
2
84
0.85
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41
4.4
41
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10
136
10
10
4
74
1.19
22018643--22018768
35
3.4
36
77
11
114
9
10
5
74
1.21
22018629--22018778
75
2.0
73
84
6
196
8
11
4
75
1.18
22019837--22019884
7
7.1
7
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2
0
58
1.10
22019830--22019884
5
11.4
5
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38
1
0
60
1.08
22019834--22019884
13
3.9
13
78
21
54
39
1
0
58
1.09
22019892--22019985
40
2.3
40
83
7
120
61
10
27
0
1.29
22027066--22027216
53
2.8
53
89
4
214
29
27
16
25
1.97
22033047--22033076
15
1.9
16
93
6
53
80
0
0
20
0.72
22044311--22044363
15
3.6
15
82
2
63
39
1
11
47
1.50
22044724--22044772
23
2.1
23
100
0
98
8
4
40
46
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22044865--22044905
19
2.2
19
87
12
59
46
0
24
29
1.53
22045865--22045905
7
5.6
7
94
5
64
65
0
0
34
0.93
22045858--22045905
23
2.1
23
92
7
80
66
0
0
33
0.92
22045854--22045912
8
7.5
8
88
7
77
66
0
1
32
1.02
22045854--22045923
31
2.3
30
79
13
81
65
0
1
32
1.01
22046026--22046079
23
2.5
22
75
13
60
57
5
5
31
1.45
22046042--22046127
25
3.7
24
79
10
81
55
5
6
31
1.50
22046150--22046281
25
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25
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2
3
35
1.29
22046764--22046937
30
5.9
30
91
2
289
21
3
50
25
1.64
22047747--22048085
74
4.7
72
83
7
370
32
24
16
27
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318