Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  48  of  318  ( 38109 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17840154--17840338
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21
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0
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2.5
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3.2
32
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1.30
17851154--17851205
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4
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2.0
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87
79
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17
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1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17857868--17857980
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18
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17866081--17866161
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2.2
36
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2.1
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19
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52
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0
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52
2
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1.12
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2
29
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4
31
0
64
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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51
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0
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0
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1.11
17960183--17960229
5
9.6
5
77
13
53
57
0
2
40
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17971472--17971663
40
4.8
40
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3
255
25
27
23
23
2.00
17971446--17971663
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255
24
27
23
24
2.00
17995279--17995324
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54
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0
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12
35
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2.1
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82
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12
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0
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1.88
18012072--18012106
6
5.8
6
100
0
70
48
17
17
17
1.81
18015824--18015852
13
2.1
14
93
6
51
0
17
0
82
0.66
18015912--18015958
5
9.4
5
100
0
94
59
0
0
40
0.97
18016051--18016091
21
1.9
22
85
5
57
53
4
0
41
1.22
18030138--18030178
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
18035662--18035687
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
18048724--18048750
11
2.5
11
100
0
54
66
0
0
33
0.92
18049033--18049095
30
2.1
30
100
0
126
38
9
11
41
1.73
18049739--18049794
26
2.2
26
78
12
64
69
1
0
28
0.98
18053154--18053195
15
2.8
15
82
13
50
33
0
2
64
1.07
18060312--18060373
30
2.1
30
96
0
115
30
16
19
33
1.94
18063594--18063657
26
2.4
26
82
7
67
29
6
3
60
1.36
18063615--18063667
26
2.0
27
89
10
83
28
3
3
64
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18064517--18064558
14
3.1
14
83
13
52
45
28
0
26
1.54
18071870--18071913
6
7.3
6
89
0
61
6
0
56
36
1.26
18072459--18072500
18
2.3
18
80
11
50
57
0
4
38
1.20
18073139--18073186
16
3.1
16
88
5
64
52
4
0
43
1.20
18073140--18073188
14
3.4
14
86
13
73
51
4
0
44
1.20
18073214--18073261
12
3.8
12
77
17
53
50
0
2
47
1.12
18075571--18075866
148
2.0
148
97
0
556
38
23
9
28
1.87
18080209--18080260
26
2.0
26
84
3
68
53
0
1
44
1.11
18085215--18085575
90
4.0
90
98
0
697
19
16
13
50
1.78
18093761--18093790
7
4.3
7
100
0
60
26
33
0
40
1.57
18100748--18100796
11
4.4
11
87
10
55
30
0
4
65
1.11
18100753--18100821
14
4.9
14
75
19
63
30
1
5
62
1.27
18100753--18100796
17
2.6
17
96
0
79
31
0
2
65
1.05
18100753--18100798
3
16.0
3
86
8
69
32
0
2
65
1.05
18101658--18101692
17
2.1
17
89
10
54
25
0
11
62
1.28
18113679--18113909
75
3.1
75
94
1
403
27
16
24
31
1.96
18113847--18114025
88
2.0
88
89
4
272
28
16
18
36
1.93
18114015--18114185
89
1.9
90
85
3
238
29
18
19
32
1.96
18115180--18115215
18
1.9
19
88
5
56
13
5
2
77
1.05
18115802--18115861
11
5.3
11
95
2
84
31
0
3
65
1.09
18115807--18115861
3
19.0
3
88
7
87
32
0
1
65
1.03
18116434--18116529
48
2.0
48
81
2
111
30
10
9
50
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18116702--18116747
17
2.6
17
86
10
58
30
0
10
58
1.32
18120927--18120965
18
2.2
18
85
0
51
28
5
0
66
1.12
18121843--18121867
9
2.8
9
100
0
50
8
8
0
84
0.79
18121883--18121956
37
2.0
37
85
12
100
21
6
4
67
1.31
18121946--18122034
22
4.0
21
77
12
72
41
1
2
55
1.20
18121959--18122034
22
3.5
22
78
10
84
42
1
2
53
1.23
18122296--18122342
18
2.8
18
75
15
55
59
0
0
40
0.97
18122514--18122582
26
2.5
28
77
13
72
52
2
1
43
1.25
18122708--18122751
21
2.1
21
84
16
56
36
2
0
61
1.09
18122853--18122895
18
2.3
18
88
4
59
58
2
0
39
1.11

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318