Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  298  of  318  ( 38109 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94853817--94853930
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1
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0
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1.58
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3.0
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94854916--94855100
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100
0
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0
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1.12
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5
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94882609--94882961
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3.6
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15
27
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
18
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94916958--94917120
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2.1
76
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229
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94918474--94918518
21
2.2
21
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2.0
277
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1.47
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19
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2
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2.8
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83
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4
4
55
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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1.39
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16
26
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
94984584--94985752
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132
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134
96
0
732
27
19
22
29
1.98
94994844--94995003
45
3.4
45
67
14
124
30
17
23
29
1.97
94994810--94995005
97
2.0
96
94
1
340
30
18
21
29
1.97
94994676--94995140
231
2.0
230
95
1
842
28
20
22
28
1.98
94994542--94995274
366
2.0
363
96
1
1351
28
20
22
28
1.99
94994905--94995648
134
5.5
134
95
0
1281
27
21
22
28
1.99
94994905--94995648
269
2.8
269
95
0
1301
27
21
22
28
1.99
94995656--94996973
88
14.9
89
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5
976
27
16
25
29
1.97
94995656--94996788
132
8.6
132
90
1
1312
27
16
25
29
1.97
94995656--94996958
132
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132
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2
871
27
16
26
29
1.97
94998597--94998642
23
2.0
23
82
0
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30
2
13
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1.50
94998874--94998910
19
1.9
19
88
0
56
40
2
5
51
1.39
95007827--95007868
18
2.3
19
87
4
59
35
9
0
54
1.33
95010062--95010144
3
27.7
3
100
0
166
67
0
32
0
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
27
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6
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29
20
7
43
1.78
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14
1.9
14
100
0
54
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0
7
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1.30
95015864--95015904
15
2.5
17
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7
50
34
0
2
63
1.08
95017795--95017838
19
2.3
20
84
7
56
27
20
11
40
1.86
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3.2
42
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20
23
29
1.99
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348
1.9
348
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3
989
28
22
23
25
1.99
95022125--95022797
86
7.7
87
92
2
921
28
22
23
25
1.99
95022994--95023280
43
6.6
43
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20
20
27
1.98
95022995--95023334
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1.97
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2.0
216
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4
583
30
18
21
28
1.97
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0
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0
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1.30
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29
20
9
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1.83
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3
30.3
3
72
22
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66
0
3
30
1.07
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18
5.6
18
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0
3
30
1.08
95026252--95026332
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3.4
24
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65
0
3
30
1.10
95026252--95026343
25
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0
3
29
1.06
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2.1
42
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2
120
30
20
16
32
1.95
95027197--95027467
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4.0
68
94
0
479
27
23
23
24
2.00
95027484--95027723
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5.5
44
70
10
170
20
22
20
36
1.95
95027477--95027739
87
3.0
87
86
1
330
20
22
20
36
1.95
95027840--95027999
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151
22
18
22
36
1.95
95027837--95028047
88
2.4
86
81
4
226
21
19
22
36
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95048604--95048654
3
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3
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11
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60
5
0
33
1.21
95048724--95048789
36
2.0
32
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82
62
1
3
33
1.20
95052752--95052782
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5.2
6
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0
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0
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0
50
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0
0
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0.96
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0
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0
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0
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0
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0
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0
1.00
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2.0
33
100
0
134
23
14
20
40
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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