Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  24  of  318  ( 38109 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9071206--9071261
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57
5
0
37
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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2.0
27
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2.5
33
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20
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0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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2.0
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18
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0
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35
1
3
58
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9317488--9317513
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100
0
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11
0
0
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2.1
19
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5
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3.1
36
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7
136
59
2
1
36
1.23
9317662--9317734
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2.1
36
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10
80
60
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1
34
1.24
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0
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2
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18
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1
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17
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2
1
42
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22
4.2
22
69
18
61
56
3
1
39
1.22
9318239--9318316
10
7.2
10
76
13
66
80
3
3
11
0.97
9318346--9318406
17
3.8
17
78
12
83
75
1
11
11
1.12
9320117--9320166
16
3.2
16
75
10
50
46
0
0
54
1.00
9331838--9331888
26
1.9
26
84
11
68
58
1
1
37
1.20
9334134--9334195
30
2.1
30
87
0
88
24
3
11
61
1.44
9334968--9334994
9
3.0
9
100
0
54
55
0
0
44
0.99
9341210--9341259
23
2.2
24
82
10
68
40
6
18
36
1.75
9346724--9346760
19
1.9
19
88
0
56
51
2
0
45
1.15
9357230--9357260
15
2.0
16
93
6
55
32
0
19
48
1.49
9361585--9361676
36
2.6
36
96
0
166
28
26
18
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9362053--9362105
23
2.5
22
85
11
74
33
1
7
56
1.38
9362145--9362580
25
17.4
25
66
22
120
31
5
6
56
1.47
9362141--9362176
11
3.3
11
88
0
54
33
0
5
61
1.19
9362141--9362225
36
2.4
34
81
14
86
32
2
4
60
1.30
9362359--9362491
49
2.7
50
77
8
137
33
5
6
54
1.47
9362380--9362543
25
6.6
25
74
14
144
33
6
4
54
1.48
9362429--9362560
52
2.6
49
80
11
117
32
5
6
56
1.46
9370847--9370890
20
2.2
20
100
0
88
50
18
4
27
1.66
9374068--9374101
15
2.2
16
89
5
52
52
2
0
44
1.16
9375754--9375803
24
2.1
24
100
0
100
56
20
8
16
1.65
9381337--9381375
18
2.2
18
90
9
62
48
0
0
51
1.00
9381722--9381778
29
1.9
30
82
10
73
43
1
0
54
1.10
9381930--9381991
19
3.2
20
76
19
69
59
0
0
40
0.97
9381930--9382000
21
3.5
21
83
11
78
60
0
0
39
0.97
9381931--9381993
20
3.0
21
84
11
78
61
0
0
38
0.96
9381958--9382008
20
2.6
19
77
19
52
66
0
0
33
0.92
9382564--9382622
20
2.9
19
80
10
55
42
1
0
55
1.09
9383782--9383824
20
2.2
20
83
8
52
48
0
6
44
1.29
9384095--9384145
25
1.9
28
88
11
81
39
3
3
52
1.38
9389406--9389448
22
2.0
22
100
0
86
32
18
16
32
1.93
9396175--9396230
24
2.5
22
82
8
60
48
0
7
44
1.30
9396830--9396877
21
2.2
23
88
7
73
33
10
4
52
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9411440--9411489
22
2.3
23
83
13
61
32
4
8
56
1.47
9426022--9426221
109
1.8
110
80
5
244
51
7
12
29
1.65
9426381--9426429
25
2.0
25
87
0
71
32
22
20
24
1.98
9430675--9430727
7
7.3
7
85
4
52
26
0
3
69
1.05
9430668--9430728
21
2.8
21
75
7
59
29
0
3
67
1.07
9431098--9431142
21
2.1
21
87
0
63
44
35
6
13
1.70
9432599--9432749
53
2.8
53
89
4
214
29
27
16
25
1.97
9439116--9439266
53
2.8
53
87
4
205
29
27
16
26
1.97
9442631--9442666
14
2.6
14
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0
54
50
8
0
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1.33
9447782--9447853
10
7.6
9
71
17
56
56
5
2
34
1.37

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318