Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  285  of  318  ( 38109 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
20
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1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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20
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16
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2.1
70
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1.96
91090434--91090631
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260
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393
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1
1222
32
13
14
38
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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T
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(0-2)
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1.96
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2.0
54
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0
130
24
19
32
23
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91172426--91172477
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1.9
27
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79
30
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17
1.97
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1.9
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51
15
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0
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0
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1.58
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44
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27
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54
0
0
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2
0
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1.15
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18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
91178527--91178801
147
1.9
149
96
1
509
46
3
2
47
1.33
91178875--91178909
17
2.0
17
88
5
52
62
0
0
37
0.95
91178985--91179016
16
1.9
17
93
6
57
46
0
0
53
1.00
91178738--91179030
120
2.4
120
90
2
464
49
5
2
42
1.38
91179046--91179253
91
2.3
90
85
5
258
47
3
4
45
1.39
91179767--91179796
12
2.5
12
94
0
51
43
20
23
13
1.86
91180060--91180086
14
1.9
14
100
0
54
48
22
7
22
1.75
91185674--91185741
19
3.4
19
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18
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39
1
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50
1.43
91185655--91185739
41
2.1
41
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0
170
36
2
9
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1.47
91189992--91190108
58
2.0
58
88
0
171
34
25
15
24
1.95
91191018--91191049
14
2.2
15
94
5
57
3
12
6
78
1.06
91191061--91191131
3
26.0
3
71
23
59
60
1
1
36
1.14
91191064--91191143
5
15.6
5
70
27
53
60
1
1
37
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91191059--91191134
8
9.8
8
88
5
120
60
1
1
36
1.13
91192719--91192787
21
3.3
21
68
8
59
43
17
24
14
1.86
91197310--91197351
20
2.1
20
100
0
84
28
4
26
40
1.76
91198389--91198441
24
2.2
24
79
0
61
47
16
15
20
1.83
91200950--91201016
31
2.2
31
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10
84
40
14
5
38
1.71
91204489--91204522
16
2.1
16
100
0
68
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5
23
29
1.78
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27
2.0
26
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10
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0
13
13
1.10
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31
2.2
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4
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1.65
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2.0
30
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26
1.55
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2.1
33
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0
109
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10
7
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1.61
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22
1.9
22
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0
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26
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1.91
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2.3
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100
0
50
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0
0
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11
2.3
11
100
0
50
84
0
0
16
0.63
91249392--91249433
22
1.9
22
85
0
57
14
38
21
26
1.91
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21
2.0
21
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21
7
4
66
1.35
91252107--91252174
33
2.1
33
91
0
109
54
7
10
27
1.61
91262481--91262539
29
2.0
29
87
12
86
27
5
11
55
1.56
91281115--91281150
12
3.0
12
95
0
63
41
5
25
27
1.77
91282809--91282854
19
2.4
19
96
3
83
84
13
2
0
0.71
91283109--91283133
8
3.1
8
100
0
50
12
12
52
24
1.72
91283181--91283235
16
3.4
16
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5
92
7
0
27
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1.19
91283412--91283458
23
2.0
23
84
12
60
61
4
2
31
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91285359--91285441
43
1.9
43
95
0
148
22
33
22
20
1.97
91286484--91286754
137
2.0
138
93
2
465
49
14
9
26
1.74
91289009--91289051
15
3.0
15
83
6
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46
32
0
20
1.51
91289014--91289100
22
4.0
22
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7
52
45
29
0
24
1.53
91289074--91289100
14
1.9
14
100
0
54
44
33
0
22
1.53
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15
2.9
15
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3
50
40
30
0
28
1.57
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41
2.1
41
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2
102
66
5
4
23
1.33
91289804--91290010
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41
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258
19
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23
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1.96
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2.2
12
100
0
52
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30
15
7
1.74
91293660--91293708
26
1.9
26
83
4
64
38
4
0
57
1.18

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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