Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  66  of  318  ( 38109 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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205
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
A
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17
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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5
15
57
22
1.57
23556416--23556518
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24
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23
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2
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1.05
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8
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12
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31
0
0
68
0.90
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17
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17
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28
0
2
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9
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28
0
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1.09
23556382--23556519
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29
2
0
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1.08
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18
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0
2
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4
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4
100
0
58
75
0
24
0
0.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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0
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22
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56
1
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38
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243
1.8
243
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2
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10
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2.0
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2.1
26
100
0
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2.0
132
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2.0
25
100
0
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1.68
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21
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2.6
137
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2.4
92
94
1
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25
19
22
32
1.97
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229
2.2
228
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19
20
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1.97
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136
2.3
136
88
3
478
26
19
20
33
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23641230--23641287
28
2.2
28
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1
0
43
1.10
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6.0
6
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0
14
2
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2.0
60
96
0
222
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0
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100
0
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1.91
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2
94
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63
51
0
0
48
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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