Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  231  of  318  ( 38109 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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5.5
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1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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205
26
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29
1.96
73531966--73532121
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1.9
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1.96
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229
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1.96
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1.81
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8.8
54
73
7
268
32
9
19
38
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73558042--73558302
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22
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2.00
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6.6
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359
23
27
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1.99
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26
21
23
1.99
73605033--73605203
46
3.7
45
76
12
186
28
27
21
22
1.99
73605038--73605207
92
1.8
93
92
1
288
28
28
21
21
1.99
73605630--73605688
29
2.0
29
90
3
91
30
25
8
35
1.86
73629560--73629683
43
2.9
43
73
3
117
33
22
15
29
1.95
73637473--73637579
29
3.7
29
79
6
110
25
30
15
28
1.96
73637782--73637816
16
2.2
16
94
0
61
14
22
14
48
1.79
73642117--73642305
79
2.3
83
82
10
232
24
21
27
25
1.99
73642123--73642307
40
4.6
41
81
11
224
23
22
28
25
1.99
73650318--73650463
40
3.7
40
81
7
163
23
21
28
26
1.99
73650318--73650486
80
2.1
80
79
7
175
25
21
27
26
1.99
73668460--73668492
12
2.8
12
100
0
66
24
36
24
15
1.93
73669089--73669208
56
2.1
56
98
0
231
45
9
23
22
1.81
73670343--73670592
79
3.2
78
80
8
258
26
21
26
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73670340--73670578
40
6.0
40
83
7
265
25
22
27
25
2.00
73673648--73673699
20
2.6
21
79
11
56
44
1
0
53
1.11
73673760--73673790
10
3.0
10
95
4
53
77
3
19
0
0.90
73674481--73674529
25
2.0
25
83
0
62
38
0
16
44
1.48
73679308--73679384
27
2.9
27
82
7
102
35
23
24
16
1.95
73680138--73680176
19
2.1
19
85
0
51
71
5
7
15
1.26
73680641--73680730
28
3.2
27
84
7
110
32
23
23
21
1.98
73680641--73680730
27
3.2
27
82
7
101
32
23
23
21
1.98
73680835--73680899
28
2.3
28
91
0
103
32
7
27
32
1.85
73689429--73689540
27
4.1
27
83
7
120
38
23
23
15
1.92
73703509--73703828
46
7.0
46
93
0
478
19
23
15
41
1.89
73708890--73709032
46
3.1
46
83
4
198
18
22
16
43
1.88
73709649--73709821
46
3.7
46
77
15
185
21
19
28
29
1.98
73709643--73709814
93
1.8
93
89
0
272
22
20
28
29
1.98
73712736--73712814
15
5.3
15
82
0
86
11
16
15
56
1.66
73712737--73712824
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
73714532--73714707
46
3.8
45
78
10
194
21
19
29
29
1.98
73714529--73714699
93
1.8
93
92
0
288
21
20
29
28
1.98
73716008--73716175
46
3.7
46
88
0
237
22
23
13
39
1.90
73716102--73716174
21
3.3
21
66
14
56
23
26
10
39
1.87
73721949--73722013
31
2.1
31
91
5
105
21
23
16
38
1.93
73722205--73722322
23
5.0
24
87
5
161
27
22
21
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73722372--73722438
20
3.3
20
93
0
116
32
20
11
34
1.90
73722372--73722427
11
5.5
11
71
16
57
32
19
12
35
1.89
73729125--73729382
40
6.5
40
89
2
351
25
27
22
23
2.00
73736274--73736531
40
6.5
40
89
2
351
25
28
22
23
1.99
73738441--73738542
37
2.8
37
95
0
177
26
30
18
24
1.98
73738661--73738916
47
5.4
47
93
1
422
28
30
8
32
1.87
73738661--73738912
96
2.6
96
93
1
418
28
30
8
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1.87
73744316--73744379
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2.1
31
93
0
110
23
23
15
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1.93
73744571--73744736
24
7.0
24
86
4
230
28
21
19
29
1.98
73744592--73744735
47
3.1
47
93
0
234
29
20
19
29
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
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