Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  15  of  318  ( 38109 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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Period
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A
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Period
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Score
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1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
A
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0.98
5974349--5974413
24
2.7
24
80
4
78
56
4
0
38
1.20
5974342--5974386
5
9.0
5
83
16
58
57
0
0
42
0.98
5979465--5979572
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
5980448--5980482
9
3.9
9
84
0
52
2
17
0
80
0.84
5980448--5980487
18
2.2
19
90
4
64
2
15
2
80
0.93
5980491--5980563
5
14.6
5
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20
64
56
4
0
39
1.19
5980492--5980534
19
2.3
19
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8
70
58
0
0
41
0.98
5980498--5980562
24
2.6
25
80
9
71
58
4
0
36
1.19
5981248--5981326
41
1.9
41
97
0
149
27
17
17
36
1.93
5982667--5982705
15
2.7
15
84
4
53
56
2
5
35
1.35
5991294--5991323
6
5.0
6
100
0
60
0
16
50
33
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5991587--5991637
25
2.0
25
85
7
68
41
5
1
50
1.37
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15
2.5
16
83
16
53
43
0
0
56
0.99
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14
2.9
15
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7
50
66
0
0
33
0.92
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33
2.0
31
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5
103
53
6
1
38
1.35
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142
2.0
142
100
0
574
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12
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1.76
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16
2.0
15
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6
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54
6
25
12
1.62
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411
2.0
411
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0
1428
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24
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1.94
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21
2.2
22
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21
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1.94
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4.5
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16
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8
9
2
78
1.05
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30
2.5
29
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4
121
9
9
1
79
0.99
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17
5.6
16
73
16
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8
8
2
80
1.00
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11
4
3
80
0.99
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2.1
36
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43
0
1
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1.08
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14
100
0
54
44
0
0
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0.99
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1
2
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6031494--6031535
21
1.9
23
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9
61
45
0
0
54
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34
2.8
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9
103
35
1
4
59
1.23
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36
3.1
36
75
15
102
34
1
4
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1.29
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26
2.2
26
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3
82
49
5
1
44
1.34
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21
2.1
22
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36
4
0
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1.18
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8
4.2
8
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7
61
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0
0
34
0.93
6038267--6038301
17
2.1
17
94
5
63
65
0
0
34
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6041549--6041607
3
19.7
3
83
0
64
25
33
1
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1.66
6041709--6041744
18
2.0
18
100
0
72
38
22
22
16
1.93
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26
3.2
26
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0
128
32
6
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1.79
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37
2.2
37
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0
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19
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1.93
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3.1
14
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24
0
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1.05
6057492--6057543
24
2.3
22
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6
59
26
0
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1.13
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21
2.2
22
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21
19
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1.94
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12
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10
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1
33
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1.58
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24
5.9
24
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0
176
1
31
18
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6079667--6079703
18
2.1
18
89
0
56
13
32
27
27
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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