Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  83  of  318  ( 38109 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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50
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1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
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0
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0
73
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32
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1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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38
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2.4
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27
1.98
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2.1
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49
77
12
186
40
13
23
22
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28436375--28436426
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3.1
16
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51
1
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1.46
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2.0
22
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0
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0
0
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53
80
0
0
19
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0
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13
217
24
24
16
33
1.95
28444596--28444773
96
1.9
97
84
3
245
24
25
17
32
1.97
28444693--28444833
51
2.7
51
83
5
133
23
23
16
36
1.94
28445947--28446081
48
2.8
47
75
7
137
19
27
15
37
1.92
28447885--28447990
34
3.2
32
75
11
88
42
0
14
43
1.45
28448060--28448551
126
3.9
126
84
3
566
38
15
16
28
1.90
28450910--28450956
21
2.3
20
82
7
58
2
14
48
34
1.56
28451204--28451246
18
2.4
18
88
0
59
44
9
25
20
1.81
28451568--28451596
14
2.1
14
93
6
51
17
13
20
48
1.81
28452685--28452725
21
2.0
22
90
9
68
60
4
7
26
1.43
28452753--28452799
21
2.1
22
84
7
60
48
0
4
46
1.21
28455363--28455532
46
3.7
45
87
3
198
43
14
21
20
1.87
28456793--28456844
25
2.1
24
82
10
61
69
1
0
28
0.99
28457022--28457070
21
2.4
21
86
3
64
32
2
30
34
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28457031--28457076
21
2.1
22
92
4
76
26
4
30
39
1.75
28457031--28457086
21
2.7
21
86
5
60
28
3
28
39
1.73
28460270--28460312
22
2.0
22
81
9
52
55
4
11
27
1.55
28492871--28492904
15
2.3
15
85
5
52
61
0
0
38
0.96
28507625--28507671
23
2.0
24
87
4
69
42
4
2
51
1.33
28513235--28513275
6
6.8
6
94
0
55
24
26
31
17
1.97
28513238--28513272
12
2.9
12
91
0
61
25
22
34
17
1.96
28515944--28515987
17
2.6
17
85
0
52
54
0
0
45
0.99
28516581--28516615
15
2.4
15
90
4
54
34
0
0
65
0.93
28524987--28525084
49
2.0
49
95
0
178
34
7
13
44
1.71
28534768--28534832
4
17.0
4
81
9
55
15
4
4
75
1.13
28534768--28534832
30
2.1
31
85
2
87
15
4
4
75
1.13
28537585--28537806
43
4.8
48
79
7
203
31
23
16
28
1.96
28541030--28541076
4
11.8
4
90
0
58
25
6
0
68
1.13
28555786--28555858
25
2.9
24
79
16
78
35
6
2
54
1.41
28555773--28555818
20
2.3
20
79
17
51
34
4
4
56
1.39
28555774--28555822
22
2.3
21
86
13
66
36
4
4
55
1.38
28565834--28565873
18
2.2
18
90
0
62
47
0
0
52
1.00
28573629--28573694
26
2.5
26
85
9
82
60
0
7
31
1.25
28573634--28573694
3
20.3
3
77
12
63
62
0
4
32
1.17
28574302--28574411
55
2.0
55
96
0
202
31
26
15
26
1.96
28576976--28577018
20
2.1
21
95
4
79
48
16
16
18
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28577171--28577226
5
10.8
5
81
11
60
3
16
0
80
0.85
28577171--28577227
6
9.7
6
81
12
57
3
15
0
80
0.84
28579183--28579228
20
2.3
20
84
0
65
80
2
2
15
0.91
28585100--28585256
79
2.0
79
88
0
233
43
15
7
33
1.74
28587403--28587431
5
5.8
5
100
0
58
0
17
0
82
0.66
28588565--28588659
38
2.5
37
78
13
97
37
12
0
49
1.41
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20
2.5
20
86
3
64
53
0
2
44
1.12
28593671--28593696
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2.0
13
100
0
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7
0
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1.30
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2.0
29
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41
3
6
48
1.47
28603615--28603744
61
2.1
61
98
1
253
30
6
9
53
1.59

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318