Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: A05 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  247  of  318  ( 38109 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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0
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Indices
Period
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Copy
Number
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Matches
Percent
Indels
Score
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1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.96
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1.97
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1.9
140
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342
31
21
20
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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28
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26
26
1.98
78802822--78802881
9
6.9
8
75
22
50
83
1
11
3
0.84
78802833--78802879
6
7.8
6
79
9
51
82
2
10
4
0.88
78802820--78802882
19
3.4
19
80
4
67
84
1
11
3
0.81
78803831--78804280
84
5.4
84
86
7
614
30
22
22
24
1.99
78803831--78804280
166
2.7
165
85
8
583
30
22
22
24
1.99
78804087--78804217
41
3.1
41
66
18
99
30
22
20
25
1.98
78804405--78804586
87
2.1
88
81
9
212
32
18
20
28
1.96
78804963--78805005
19
2.2
20
91
8
70
39
9
16
34
1.80
78822309--78822338
14
2.1
14
93
0
51
46
20
0
33
1.51
78822457--78822495
19
2.0
20
90
5
62
33
15
0
51
1.44
78823203--78823301
33
3.2
33
77
14
109
25
26
24
24
2.00
78823175--78823301
61
2.1
61
86
2
175
25
26
25
22
2.00
78823175--78823301
28
4.2
31
75
19
108
25
26
25
22
2.00
78823647--78823839
27
7.1
27
91
0
278
25
21
18
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78825861--78825998
41
3.2
43
77
10
113
30
26
16
26
1.97
78825879--78826011
45
3.0
43
76
9
128
33
26
16
24
1.96
78836807--78836836
13
2.2
14
94
5
53
43
0
13
43
1.43
78839595--78839634
19
2.2
18
90
4
62
45
10
5
40
1.60
78840825--78840886
17
3.6
17
72
8
54
67
6
3
22
1.28
78840875--78840913
12
3.2
12
82
13
53
71
5
5
17
1.23
78840884--78840929
20
2.4
18
82
7
56
73
2
4
19
1.10
78840880--78841016
12
11.2
12
70
20
63
67
3
4
24
1.25
78840950--78841098
3
49.3
3
74
6
131
62
2
6
28
1.33
78840923--78840995
32
2.3
32
84
9
89
65
5
2
26
1.27
78841211--78841292
41
2.0
41
100
0
164
48
12
21
17
1.79
78842586--78842720
44
3.0
44
76
8
139
24
23
23
28
2.00
78842964--78843086
45
2.7
45
91
0
183
26
23
19
30
1.98
78843621--78843645
12
2.1
12
100
0
50
24
16
28
32
1.96
78843841--78843880
3
13.7
3
84
5
55
5
25
0
70
1.08
78846857--78847118
39
6.7
40
87
7
328
24
27
22
25
2.00
78854857--78855118
39
6.6
39
87
6
302
24
26
22
26
2.00
78867550--78867594
15
2.9
15
83
6
63
48
8
0
42
1.34
78873438--78873724
50
6.1
46
77
12
244
28
17
29
24
1.97
78873447--78873662
46
4.7
44
77
12
202
28
17
29
24
1.97
78873438--78873724
140
2.0
141
83
6
357
28
17
29
24
1.97
78884803--78884840
14
2.9
13
81
11
51
18
13
10
57
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78886898--78886988
44
2.1
44
97
0
173
26
16
18
38
1.92
78887849--78887961
27
4.2
27
80
2
120
23
24
14
37
1.92
78888506--78888566
22
2.9
20
70
15
52
57
3
0
39
1.15
78896458--78896483
13
2.0
13
100
0
52
30
0
23
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1.53
78903410--78903483
29
2.6
29
82
0
94
31
31
12
25
1.92
78907562--78907635
29
2.6
29
89
4
105
27
31
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1.95
78920382--78920417
11
3.2
11
88
7
54
38
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1.79
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0
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18
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1.97
78927894--78928533
210
3.0
210
84
1
773
32
24
18
25
1.97
78928607--78928656
25
2.0
25
100
0
100
28
16
20
36
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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