Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: A05 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  68  of  318  ( 38109 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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26
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1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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4
21
27
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24244140--24244167
10
2.8
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1.90
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19
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5.7
9
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13
61
66
0
33
0
0.92
24258528--24258588
31
2.0
29
90
6
95
68
0
31
0
0.89
24258528--24258589
7
8.4
7
91
7
79
67
0
32
0
0.91
24258528--24258588
15
4.1
15
89
6
88
68
0
31
0
0.89
24269311--24269343
15
2.2
15
100
0
66
36
0
24
39
1.56
24282489--24282541
24
2.2
23
83
12
63
33
0
3
62
1.13
24283216--24283265
24
2.0
24
84
3
64
26
2
4
68
1.18
24285229--24285285
20
2.9
19
73
21
55
47
0
1
50
1.11
24285446--24285489
20
2.1
20
83
8
52
72
0
15
11
1.11
24285466--24285545
14
5.6
14
72
15
58
66
2
28
2
1.18
24285931--24285961
16
2.0
16
93
6
55
48
0
12
38
1.42
24288539--24288580
13
3.2
13
86
6
57
2
21
0
76
0.90
24291143--24291176
6
5.5
6
96
3
59
50
20
0
29
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24293439--24293488
15
3.3
15
74
0
55
56
2
10
32
1.44
24295408--24295457
24
2.0
25
88
11
77
66
4
4
26
1.27
24295743--24295787
14
3.3
14
79
17
58
42
0
0
57
0.98
24295764--24295808
19
2.3
19
88
11
65
44
0
2
53
1.13
24297338--24297414
25
3.1
25
78
9
68
70
3
10
15
1.30
24300017--24300090
29
2.6
28
82
6
94
45
0
4
50
1.20
24300148--24300220
34
2.2
32
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13
87
39
0
9
50
1.35
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20
2.1
19
90
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41
0
20
38
1.53
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20
2.1
19
90
9
62
41
0
20
38
1.53
24303917--24304363
223
2.0
223
100
0
894
36
4
24
34
1.77
24306048--24306081
15
2.3
15
89
0
50
44
0
20
35
1.52
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128
2.6
126
76
11
309
35
17
17
29
1.93
24309762--24309815
21
2.5
21
82
8
65
24
11
7
57
1.58
24316999--24317190
99
1.9
98
84
5
253
29
9
18
42
1.81
24324211--24324251
19
2.0
21
86
9
59
56
9
0
34
1.32
24326649--24326732
3
27.0
3
71
9
53
29
4
34
30
1.78
24326649--24326696
21
2.3
21
92
0
78
27
2
37
33
1.69
24327998--24328039
15
2.5
18
85
11
54
40
2
0
57
1.12
24328168--24328206
20
1.9
21
89
5
62
30
2
0
66
1.05
24332104--24332146
17
2.5
17
77
7
52
58
0
4
37
1.19
24341900--24341934
17
2.1
17
100
0
70
31
28
0
40
1.57
24355248--24355282
12
2.9
12
91
0
52
65
11
22
0
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24356104--24356146
14
3.0
14
80
16
52
23
2
6
67
1.27
24357188--24357262
31
2.4
31
79
0
96
44
10
6
38
1.66
24360325--24360378
26
2.1
26
96
0
99
42
5
7
44
1.55
24362847--24362895
23
2.1
23
81
7
55
32
14
18
34
1.91
24363019--24363106
19
4.3
19
70
22
61
54
2
0
43
1.12
24372104--24372142
17
2.2
19
90
9
64
25
0
0
74
0.82
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6
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4
52
18
0
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73
1.06
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21
2.0
21
85
0
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57
4
0
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1.20
24383997--24384168
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4.3
40
86
2
204
26
27
20
25
1.99
24383999--24384221
40
5.6
39
80
5
198
26
26
21
26
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318