Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  35  of  318  ( 38109 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13126213--13126305
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27
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39
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
21
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0
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1
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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20
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20
28
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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14
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1.75
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6
4.5
6
100
0
54
18
48
0
33
1.49
13358921--13359120
3
66.7
3
73
5
118
9
26
30
34
1.88
13358981--13359118
36
3.7
36
79
11
132
11
26
28
33
1.91
13358995--13359120
42
3.0
42
86
0
171
9
26
29
34
1.88
13359586--13359649
21
3.2
21
78
13
71
4
28
31
35
1.78
13359596--13359651
15
3.5
15
75
17
51
3
26
33
35
1.74
13359594--13359655
21
3.0
21
78
4
72
3
27
33
35
1.73
13367126--13367201
40
1.9
39
84
12
102
34
5
2
57
1.35
13379292--13379363
20
3.6
20
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15
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36
2
1
59
1.20
13379336--13379399
28
2.3
27
76
15
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26
3
3
67
1.21
13386261--13386325
25
2.6
25
73
9
60
41
3
1
53
1.25
13386528--13386614
39
2.3
39
94
4
151
34
21
5
37
1.78
13386540--13386601
21
3.1
21
60
21
51
37
22
4
35
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13396236--13396280
11
3.9
11
80
11
54
35
0
2
62
1.08
13398413--13398589
46
3.8
46
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1
230
42
12
24
20
1.87
13404103--13404177
37
2.0
37
100
0
150
33
16
16
34
1.90
13410890--13410950
30
2.0
30
81
6
70
42
4
0
52
1.23
13423862--13423918
28
2.0
28
83
13
71
63
0
0
36
0.95
13423862--13423934
30
2.4
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11
80
60
1
0
38
1.06
13423877--13423940
23
2.9
21
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9
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60
1
0
37
1.06
13424904--13424938
4
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4
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0
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2
0
22
0.95
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2.0
21
100
0
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9
4
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1.59
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2
44
1.34
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2.1
21
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22
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19
2.1
19
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9
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5
0
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1.21
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25
2.0
28
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11
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3
1
42
1.31
13463176--13463240
20
3.3
19
74
20
62
55
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6
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1.49
13463711--13463768
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2.8
20
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1.21
13472429--13472501
30
2.4
29
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36
1.36
13473113--13473228
58
2.0
58
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0
223
24
19
24
31
1.98
13475532--13475685
64
2.4
64
92
5
249
31
8
17
42
1.79
13475828--13475985
41
3.9
41
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187
20
18
27
33
1.96
13476650--13476684
15
2.3
15
90
9
54
25
0
22
51
1.48
13482427--13482603
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2.8
64
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10
249
31
8
17
42
1.79
13482723--13482880
41
3.9
41
85
6
187
20
18
27
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13483544--13483578
15
2.3
15
90
9
54
25
0
22
51
1.48
13494721--13494754
16
2.1
16
88
0
50
50
14
17
17
1.79
13499311--13499344
16
2.1
16
88
0
50
50
14
17
17
1.79
13503828--13503871
22
2.1
21
84
16
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27
20
29
22
1.99
13512001--13512047
18
2.6
19
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53
44
2
4
48
1.34
13512809--13512849
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2.0
21
100
0
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185
20
18
27
33
1.96
13530632--13530666
15
2.3
15
90
9
54
25
0
22
51
1.48

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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