Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: A05 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  271  of  318  ( 38109 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.13
Indices
Period
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Copy
Number
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Matches
Percent
Indels
Score
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19
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19
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1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
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86813834--86814323
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1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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80
12
70
37
1
20
40
1.63
86931126--86931177
27
2.0
26
84
3
68
34
21
26
17
1.95
86938591--86938642
27
2.0
26
84
3
68
34
21
26
17
1.95
86942203--86942233
14
2.2
14
94
0
53
16
3
3
77
1.03
86944214--86944245
13
2.5
13
100
0
64
31
25
18
25
1.98
86948294--86948379
40
2.2
40
82
0
100
33
10
16
39
1.83
86948587--86948697
45
2.5
45
82
2
143
24
16
15
44
1.86
86948564--86948705
45
2.9
50
74
17
136
23
18
16
41
1.89
86948677--86948710
6
5.7
6
85
0
50
17
23
14
44
1.86
86955189--86955543
48
7.5
49
76
9
222
28
20
26
24
1.99
86955278--86955544
142
1.9
145
82
8
350
27
20
27
23
1.99
86957405--86957590
40
4.6
39
86
6
214
25
21
26
25
1.99
86957452--86957623
80
2.2
79
80
13
201
29
19
25
26
1.98
86961535--86961706
46
3.7
45
79
13
197
22
20
28
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86961531--86961701
93
1.8
93
93
0
297
21
20
29
28
1.98
86961931--86961968
19
2.0
20
85
15
53
36
0
23
39
1.55
86963227--86963309
28
3.0
28
89
3
123
31
20
25
22
1.98
86964519--86964551
12
2.6
13
85
9
50
45
0
45
9
1.35
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20
2.0
20
90
0
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26
26
36
9
1.88
86979781--86979907
46
2.8
46
77
14
129
22
31
18
27
1.97
86979819--86979947
46
2.8
45
80
10
127
21
30
20
27
1.98
86990317--86990349
14
2.4
14
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10
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60
0
0
39
0.97
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2.0
40
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20
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1.84
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2.0
30
93
0
104
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4
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31
1.70
87004786--87004842
18
3.5
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45
5
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29
1.72
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2.7
66
92
0
293
18
19
18
43
1.88
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46
2.2
48
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3
147
34
14
24
26
1.94
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39
2.2
41
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4
119
39
3
4
52
1.38
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17
2.1
17
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58
0
0
41
0.98
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16
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0
0
31
0.90
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12
2.6
11
90
10
51
66
0
0
33
0.92
87023492--87023525
11
3.1
11
95
0
59
11
8
14
64
1.49
87025602--87025647
23
2.0
23
100
0
92
17
21
30
30
1.96
87028273--87028332
18
3.3
18
75
9
59
30
15
11
43
1.82
87028879--87028905
3
9.0
3
100
0
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0
0
33
0.92
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19
2.4
19
81
11
56
0
27
0
72
0.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87029585--87029609
13
1.9
13
100
0
50
12
16
0
72
1.13
87035678--87035711
15
2.2
16
89
5
52
44
0
14
41
1.45
87035888--87035937
23
2.2
23
85
7
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6
2
58
1.34
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6
4.2
6
100
0
50
84
0
16
0
0.63
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27
5.2
27
80
11
173
35
23
23
17
1.95
87037901--87038041
54
2.6
54
89
2
230
35
23
23
17
1.95
87039661--87039768
26
4.2
26
95
0
189
37
25
5
31
1.79
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27
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108
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22
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1.95
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4.2
26
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0
180
37
25
5
32
1.79
87048128--87048177
23
2.1
23
88
7
73
42
0
8
50
1.32

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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