Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  34  of  318  ( 38109 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
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31
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1.95
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1.93
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1.93
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6.2
52
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352
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14
22
28
1.93
12853657--12854035
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1.93
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55
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2
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0
21
1
0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12879541--12879600
13
4.5
13
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12
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0
20
1
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100
0
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51
0
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2.1
15
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53
6
0
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1.27
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0
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1.96
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36
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0
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2.4
25
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13
61
65
3
0
31
1.09
12925657--12925815
78
2.0
78
100
0
318
40
8
7
42
1.64
12926701--12926739
18
2.2
18
86
9
53
38
0
0
61
0.96
12926699--12926749
10
5.3
10
75
17
54
37
0
0
62
0.95
12926700--12926749
18
2.6
19
73
20
50
38
0
0
62
0.96
12927737--12927776
18
2.2
18
86
8
55
20
0
12
67
1.22
12931756--12931799
19
2.3
19
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0
70
2
29
2
65
1.16
12931765--12931802
19
2.0
19
100
0
76
5
26
5
63
1.37
12964266--12964335
29
2.3
29
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34
1.47
12972720--12972780
31
2.0
31
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42
0
1
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1.09
12975299--12975323
6
4.2
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100
0
50
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16
16
1.90
12984705--12984754
24
2.1
24
100
0
100
30
28
12
30
1.92
12985171--12985208
8
4.6
8
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3
67
28
36
0
34
1.58
12994110--12994223
58
2.0
58
96
0
210
23
15
20
40
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13003978--13004012
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1.9
18
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0
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28
14
25
31
1.95
13012758--13012783
3
8.7
3
100
0
52
0
30
0
69
0.89
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23
2.0
23
82
8
56
35
0
8
55
1.31
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16
2.1
16
94
0
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21
12
9
57
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23
2.0
23
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8
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66
2
2
28
1.15
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2.2
31
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7
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34
10
4
50
1.56
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1.9
32
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0
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4
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1.49
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0
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0
1.38
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2.1
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1.84
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2
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0
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0
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2.2
18
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0
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0
2
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1.14
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2.0
26
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0
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11
11
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1.78
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5
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0
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0
0
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17
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1
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2.0
25
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0
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6
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30
1.75
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50
2.0
50
94
0
177
46
25
5
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1.74
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137
2.0
138
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3
448
48
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14
24
1.79
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17
3.4
18
76
14
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60
3
0
35
1.12
13098738--13098798
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4.0
15
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10
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65
3
0
31
1.09
13098738--13098790
23
2.3
23
80
6
63
66
1
0
32
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13099590--13099623
17
2.0
17
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0
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50
0
5
1.26
13104229--13104262
17
2.0
17
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0
59
44
50
0
5
1.26
13111045--13111074
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1.9
15
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6
51
86
10
3
0
0.67
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2.0
16
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48
0
0
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1.00
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41
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15
24
1.94
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3.6
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82
2
338
35
25
16
23
1.95
13119217--13119510
122
2.4
123
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7
337
35
25
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0
100
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241
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1.90
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9
14.6
9
78
8
130
46
21
0
30
1.57

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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