Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  17  of  318  ( 38109 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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138
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2.0
43
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0
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4
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1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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5
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1.9
109
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20
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31
16
21
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1
3
55
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6748604--6748646
20
2.2
20
100
0
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4
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1.60
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1.43
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0
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0
63
0.95
6801078--6801111
3
11.3
3
100
0
68
67
0
0
32
0.91
6802335--6802399
32
2.0
33
85
8
89
40
0
3
56
1.15
6802388--6802435
19
2.5
20
83
13
64
39
0
6
54
1.26
6802947--6802971
11
2.3
11
100
0
50
64
0
0
36
0.94
6805111--6805147
19
1.9
19
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0
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64
2
5
27
1.28
6805837--6805866
5
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5
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0
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0
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5
12.0
5
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10
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0
1
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1.07
6811420--6811472
27
2.0
26
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7
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43
3
1
50
1.30
6811546--6811575
11
2.7
11
94
0
51
33
3
0
63
1.11
6814978--6815015
18
2.1
18
100
0
76
5
28
10
55
1.56
6826329--6826417
18
4.9
18
88
0
115
30
22
15
31
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6826327--6826417
36
2.5
36
89
0
128
29
21
16
31
1.95
6842841--6842885
23
2.0
22
83
8
56
31
15
40
13
1.86
6846492--6846518
4
6.8
4
100
0
54
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0
0
77
0.76
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30
2.0
30
86
3
84
26
1
10
61
1.37
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18
2.3
21
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70
6
0
23
1.10
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20
2.3
21
85
7
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34
2
4
58
1.30
6862623--6862658
11
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11
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0
54
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0
2
19
0.88
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10
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10
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4
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1.25
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57
2.3
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133
33
5
1
59
1.29
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19
4.1
19
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12
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33
2
1
62
1.17
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57
2.0
59
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31
5
1
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1.28
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21
2.0
21
100
0
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46
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13
30
1.75
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135
2.0
134
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0
492
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13
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1.89
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22
1.9
22
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4
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37
2
2
58
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1.9
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135
51
3
7
38
1.45
6892182--6892225
19
2.3
19
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7
63
38
4
0
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1.20
6907877--6907931
21
2.6
21
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0
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20
10
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1.86
6909364--6909395
2
16.0
2
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0
55
0
46
0
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1.00
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25
2.0
25
100
0
100
56
4
8
32
1.47
6921843--6921897
27
2.0
27
92
0
92
69
9
9
12
1.38
6921842--6921912
27
2.5
27
82
13
81
71
8
7
12
1.29
6921993--6922033
20
2.0
20
85
9
55
75
2
0
21
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6934787--6934818
16
1.9
17
93
6
57
59
3
0
37
1.13
6946984--6947024
20
2.0
20
85
9
55
75
2
0
21
0.92
6959789--6959823
16
2.4
14
90
9
52
62
2
0
34
1.10
6960912--6960970
27
2.3
26
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18
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37
5
5
52
1.46
6965003--6965045
9
4.7
9
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13
52
27
0
0
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0.85
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20
2.0
20
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0
0
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11
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0
0
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33
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26
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0
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14
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6976776--6976802
13
2.1
13
100
0
54
25
29
14
29
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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