Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  70  of  318  ( 38109 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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1.8
101
83
10
248
33
13
13
39
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24755472--24755680
101
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14
36
1.81
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1.8
244
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4
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14
17
33
1.90
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58
1.38
24783462--24783525
33
1.9
33
96
0
119
32
42
9
15
1.79
24785857--24786019
81
2.0
81
87
0
236
27
17
17
37
1.92
24791992--24792172
89
2.0
89
94
0
317
49
5
4
39
1.48
24795785--24795821
19
1.9
19
88
0
56
59
0
37
2
1.12
24796173--24796258
36
2.3
36
84
4
109
22
10
23
44
1.83
24797696--24797793
40
2.5
40
89
3
153
45
20
10
23
1.81
24799457--24799496
15
2.7
15
84
0
53
37
32
10
20
1.85
24799963--24800052
6
15.0
6
88
0
72
55
14
6
23
1.62
24800062--24800110
12
4.1
12
89
0
71
59
12
6
22
1.55
24800071--24800110
6
6.7
6
85
0
53
62
12
5
20
1.48
24800576--24800615
21
1.9
21
100
0
80
25
30
17
27
1.97
24801083--24801125
23
1.9
22
85
4
59
65
2
4
27
1.25
24808437--24808471
3
11.7
3
87
0
52
40
0
31
28
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24809616--24809683
29
2.3
29
89
0
100
52
10
4
32
1.55
24812400--24812451
27
1.9
27
88
0
77
26
30
19
23
1.98
24813711--24814067
111
3.3
108
82
8
404
50
5
7
35
1.56
24813754--24814115
111
3.3
110
82
5
428
49
6
9
34
1.61
24814795--24814853
29
2.0
30
93
3
102
50
11
3
33
1.56
24816372--24816437
30
2.2
29
82
12
80
54
7
1
36
1.38
24816580--24816608
7
4.1
7
100
0
58
31
41
13
13
1.84
24821289--24821351
31
2.0
34
85
14
91
49
4
0
46
1.23
24822810--24822845
3
12.0
3
100
0
72
0
33
0
66
0.92
24822814--24822875
18
3.4
18
80
12
58
4
24
1
69
1.17
24829773--24829820
24
2.1
24
84
7
64
12
20
6
60
1.54
24830355--24830401
6
7.8
6
100
0
94
31
0
17
51
1.46
24830407--24830437
6
5.2
6
100
0
62
19
0
16
64
1.29
24834772--24834923
76
2.0
76
96
0
277
34
8
24
32
1.86
24842138--24842173
17
2.2
16
95
5
63
91
0
8
0
0.41
24845438--24845530
30
3.1
30
92
0
150
58
12
3
25
1.50
24846169--24846211
22
2.0
22
90
0
68
20
6
9
62
1.48
24848681--24848713
17
2.1
16
88
11
50
30
0
0
69
0.88
24848760--24848818
21
2.8
22
80
7
61
22
0
8
69
1.15
24848789--24848838
26
2.0
24
88
7
73
30
0
6
64
1.18
24853680--24853721
12
3.6
12
80
3
50
30
0
0
69
0.89
24853679--24853731
23
2.3
23
83
6
63
33
0
1
64
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24858298--24858339
21
2.0
21
95
0
75
45
19
21
14
1.85
24860448--24860472
10
2.5
10
100
0
50
36
8
0
56
1.29
24860916--24861104
85
2.2
85
80
7
195
40
16
9
33
1.81
24861504--24861611
10
11.1
10
70
11
55
30
5
1
62
1.29
24861565--24861607
19
2.3
19
87
0
59
23
2
2
72
1.08
24861589--24861647
27
2.1
28
81
12
77
38
3
0
57
1.15
24861595--24861649
27
2.0
27
89
6
85
40
3
0
56
1.17
24863288--24863320
17
1.9
17
93
0
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21
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33
1.90
24866275--24866313
6
6.5
6
100
0
78
0
15
48
35
1.45
24866700--24866744
13
3.3
14
84
12
58
60
0
6
33
1.23

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318