Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  45  of  318  ( 38109 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16804779--16804830
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1.29
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0
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9
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2.0
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2
31
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16810662--16810844
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2
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0
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3
30
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21
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2
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2.0
16
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6
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51
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22
19
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
1.99
16861715--16862268
227
2.4
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26
19
26
27
1.99
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2.2
73
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1.99
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17
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0
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0
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37
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23
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1
1
57
1.20
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16
2.1
16
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60
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14
29
29
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43
2.8
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17
27
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13
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0
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3.4
40
78
7
148
25
17
25
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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2
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1.45
16875814--16875866
23
2.3
23
83
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5
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56
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16876121--16876153
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11.0
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0
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28
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1
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23
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1.91
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138
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1.90
16902815--16902917
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118
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126
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3
618
28
15
15
40
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16906175--16906672
252
2.0
251
86
3
707
27
15
15
40
1.88
16909042--16909113
34
2.1
34
85
10
94
41
15
2
40
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2.0
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0
0
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53
0
0
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26
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22
75
31
6
2
59
1.35
16952718--16952757
7
5.7
7
90
0
62
32
0
10
57
1.32
16952718--16952757
21
1.9
21
100
0
80
32
0
10
57
1.32
16953234--16953302
30
2.3
30
79
0
84
27
40
18
13
1.88
16953809--16953946
56
2.5
56
96
0
258
37
4
8
49
1.54
16956982--16957273
126
2.3
124
81
4
329
29
17
16
36
1.92
16956974--16957363
125
3.1
125
80
5
403
30
16
15
36
1.91
16957463--16957505
12
3.6
12
78
12
52
41
0
0
58
0.98
16957541--16957603
31
2.1
31
84
3
83
47
36
0
15
1.46
16960222--16960261
6
6.8
6
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13
57
0
30
0
70
0.88
16961613--16961645
16
2.1
16
100
0
66
57
0
0
42
0.98
16961690--16961732
17
2.4
18
80
7
52
46
0
0
53
1.00
16961727--16961756
10
2.9
10
95
5
51
50
10
0
40
1.36
16965009--16965080
36
2.1
35
86
5
101
50
2
1
45
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16975516--16975544
6
4.8
6
100
0
58
17
0
65
17
1.27
16980364--16980389
12
2.2
12
100
0
52
92
7
0
0
0.39
16982328--16982367
20
2.0
21
85
5
55
22
17
0
60
1.37
16985171--16985324
18
8.6
18
81
1
166
35
13
12
37
1.84
16985171--16985324
54
2.9
54
85
1
193
35
13
12
37
1.84
16985475--16985566
44
2.1
44
83
4
114
35
26
19
18
1.95
16986884--16986908
6
4.2
6
100
0
50
84
0
0
16
0.63
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672
2.0
672
100
0
2698
36
17
20
25
1.94
17011839--17011888
20
2.5
20
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3
73
54
10
8
28
1.62
17014593--17014646
27
2.0
28
88
3
83
29
3
0
66
1.09
17015606--17015647
14
2.8
15
80
19
52
30
2
0
66
1.04
17015609--17015640
17
1.9
17
93
6
57
34
3
0
62
1.11
17022555--17022579
13
1.9
13
100
0
50
36
8
16
40
1.77
17022844--17022904
19
3.1
19
81
9
70
50
0
1
47
1.10
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4
6.5
4
100
0
52
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0
23
0
0.78
17032441--17032465
12
2.1
12
100
0
50
32
28
8
32
1.86
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14
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14
100
0
54
44
0
18
37
1.50
17043184--17043235
15
3.2
15
73
19
50
44
0
1
53
1.11
17043329--17043370
22
1.9
22
85
0
57
47
0
0
52
1.00
17047253--17047281
14
2.0
15
93
6
51
31
0
0
68
0.89
17047306--17047366
22
2.8
20
74
13
59
63
4
0
31
1.15
17047778--17047802
7
3.6
7
100
0
50
44
0
12
44
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17047916--17047960
20
2.3
19
84
3
54
35
2
0
62
1.08
17048124--17048196
31
2.4
30
75
8
76
45
4
4
46
1.41
17050039--17050074
18
2.0
18
100
0
72
33
5
22
38
1.77
17064124--17064153
16
1.9
15
93
6
51
40
6
3
50
1.45
17069207--17069320
56
2.0
56
94
0
201
22
24
10
42
1.85
17072301--17072601
149
2.0
146
84
4
388
37
7
8
46
1.63
17073168--17073213
11
4.2
11
85
0
56
69
4
2
23
1.17
17073168--17073219
14
3.8
14
78
12
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5
1
23
1.20
17073174--17073219
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2.1
22
83
0
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69
4
2
23
1.17
17101658--17101682
3
8.3
3
100
0
50
32
0
0
68
0.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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