Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  300  of  318  ( 38109 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
95438121--95438173
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28
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1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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2.9
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Period
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Score
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1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
95564934--95564970
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0
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11.0
3
100
0
66
66
0
33
0
0.92
95596027--95596094
14
4.9
14
76
7
57
47
39
1
11
1.49
95596038--95596095
21
2.8
21
82
12
66
46
39
0
13
1.44
95596054--95596096
21
2.0
22
90
4
70
46
34
0
18
1.50
95603458--95603581
60
2.1
59
81
4
142
33
6
1
58
1.33
95603583--95603634
25
2.1
25
82
10
63
36
1
1
59
1.19
95603659--95603690
10
3.1
10
91
8
55
21
0
0
78
0.76
95608394--95608449
19
2.9
19
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5
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51
10
0
37
1.37
95616562--95616621
30
2.0
30
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0
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16
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36
1.75
95616922--95616976
27
2.0
27
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18
0
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1.48
95617493--95617550
12
5.0
12
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36
0
3
60
1.14
95626155--95626204
21
2.4
22
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12
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68
2
2
28
1.12
95627262--95627336
6
12.5
6
97
0
105
41
0
58
0
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95629462--95629522
30
2.0
30
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0
77
6
11
11
70
1.33
95629467--95629529
30
2.1
30
81
0
72
9
9
9
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1.32
95630471--95630530
27
2.2
26
80
11
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41
3
1
53
1.27
95630480--95630532
27
1.9
28
88
3
81
39
1
1
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1.21
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7
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7
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0
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48
1
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1.42
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25
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63
2
0
34
1.06
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14
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0
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19
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0
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1.27
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2.0
16
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51
0
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1.17
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2.0
21
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1.50
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2.0
63
100
0
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6
21
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4
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4
100
0
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26
23
23
26
2.00
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12
3.4
12
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12
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72
18
0
9
1.10
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13
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0
50
67
18
0
13
1.23
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21
2.0
23
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33
1.70
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2.0
30
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84
52
6
3
37
1.45
95658606--95658667
29
2.1
29
84
6
79
48
8
4
38
1.54
95664852--95664903
16
3.2
16
94
0
86
28
0
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34
1.58
95664884--95664978
45
2.1
45
88
1
138
34
7
25
32
1.84
95665140--95665174
18
2.0
17
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5
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51
0
0
48
1.00
95665277--95665443
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3.6
46
71
13
146
47
3
2
46
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95665336--95665407
28
2.6
28
84
8
85
51
2
0
45
1.15
95665575--95665619
22
2.0
22
100
0
90
42
13
0
44
1.43
95670426--95670454
15
1.9
15
100
0
58
62
6
6
24
1.45
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17
2.7
20
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18
70
10
0
44
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1.37
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17
2.7
20
78
18
70
10
0
44
46
1.37
95687183--95687296
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2.0
58
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1
194
21
15
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1.77
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57
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3
132
20
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1.77
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33
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1.90
95702702--95702829
62
2.1
62
100
0
256
47
10
12
28
1.75

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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