Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  37  of  318  ( 38109 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
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Indels
Score
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13993738--13993830
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1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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1.96
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1.96
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28
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1.99
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1
1
43
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14148861--14148919
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1.9
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1.28
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0
1.00
14187897--14187934
19
2.0
19
100
0
76
52
15
15
15
1.75
14191513--14191543
15
2.1
15
100
0
62
38
25
12
22
1.90
14191552--14191593
20
2.1
20
90
0
66
30
16
11
40
1.85
14194710--14194740
15
2.1
15
100
0
62
38
25
12
22
1.90
14199177--14199489
40
7.7
40
77
9
283
23
21
25
29
1.99
14199158--14199500
82
4.2
82
91
1
499
22
19
25
32
1.98
14199661--14199994
44
7.6
45
77
4
268
29
26
16
27
1.97
14199577--14200011
44
9.8
44
73
8
222
28
27
16
27
1.97
14199661--14199953
132
2.2
132
91
0
478
27
26
17
28
1.98
14199889--14200417
46
11.8
46
65
13
156
28
24
19
27
1.98
14199960--14200816
134
6.4
134
95
1
1477
29
23
20
26
1.99
14200493--14200686
46
4.3
46
66
10
139
30
23
20
25
1.98
14199960--14200816
269
3.2
268
94
1
1479
29
23
20
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14199960--14200816
403
2.1
403
94
1
1497
29
23
20
26
1.99
14200737--14201334
88
6.8
89
76
4
435
29
26
16
27
1.97
14200767--14201334
132
4.3
132
92
0
884
30
26
16
27
1.97
14200767--14201334
265
2.1
264
90
0
893
30
26
16
27
1.97
14205605--14205648
19
2.3
20
84
7
56
40
11
20
27
1.86
14210646--14210725
21
3.7
21
73
8
72
47
2
1
48
1.23
14210698--14210742
16
2.7
17
79
6
56
46
0
0
53
1.00
14223357--14223605
50
4.8
50
85
4
284
20
29
24
26
1.99
14223356--14223605
100
2.4
104
88
6
357
20
29
24
26
1.99
14223700--14223731
13
2.5
13
94
0
55
56
12
0
31
1.37
14223943--14224000
30
1.9
30
89
0
89
31
24
3
41
1.71
14225669--14226269
297
2.0
297
99
0
1193
36
21
13
28
1.91
14226441--14226617
47
3.8
47
76
12
193
31
28
18
22
1.97
14226449--14226618
94
1.8
93
88
1
259
30
28
18
22
1.97
14227039--14227098
30
2.0
30
87
6
86
28
26
8
36
1.85
14231352--14231391
21
2.0
20
85
5
53
52
15
12
20
1.74
14236949--14237268
46
7.0
46
89
0
399
20
24
15
39
1.92
14243293--14243426
39
3.4
39
74
12
114
28
26
20
23
1.99
14244989--14245033
5
9.0
5
100
0
90
60
0
0
40
0.97
14246517--14246553
20
1.9
20
88
5
58
51
8
0
40
1.32
14256260--14256289
3
10.0
3
92
0
51
63
0
33
3
1.11
14257530--14257581
23
2.3
23
83
12
63
48
3
0
48
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14257585--14257612
6
4.7
6
100
0
56
46
0
0
53
1.00
14257577--14257612
18
2.0
18
88
0
54
47
0
2
50
1.15
14258043--14258068
7
3.7
7
100
0
52
11
15
0
73
1.11
14266204--14266269
21
3.0
22
74
14
55
45
1
3
50
1.26
14271338--14271411
33
2.2
33
82
0
85
22
10
50
16
1.76
14274500--14274562
24
2.8
21
76
21
65
0
26
0
73
0.84
14274509--14274562
14
3.9
14
80
2
56
0
27
0
72
0.85
14274687--14274732
21
2.2
21
96
0
83
10
19
39
30
1.86
14286970--14287095
25
5.1
25
76
4
85
31
21
26
20
1.98
14287002--14287106
25
4.2
25
80
4
104
32
17
28
21
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318