Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  39  of  318  ( 38109 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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25
2.2
24
90
3
81
61
14
5
18
1.52
14860618--14860725
22
4.6
25
80
9
104
41
16
22
19
1.90
14861857--14861901
17
2.6
18
82
13
58
53
0
4
42
1.21
14873478--14873522
23
2.0
22
86
8
63
13
4
4
77
1.07
14876058--14876090
7
4.9
7
96
3
59
0
12
0
87
0.53
14878071--14878101
6
5.0
6
92
7
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0
16
0
0.64
14878074--14878101
13
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13
100
0
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0
14
0
0.59
14879907--14879970
12
5.9
11
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0
0
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0
0
57
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40
1
1
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1.18
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3
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3
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0
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0
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100
0
54
59
7
3
29
1.42
14886504--14886540
19
1.9
19
94
0
65
67
2
0
29
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14889736--14889774
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2.0
20
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10
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30
0
15
53
1.42
14893087--14893232
62
2.4
62
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2
231
33
12
21
32
1.91
14898625--14898681
28
2.0
28
96
0
105
31
17
3
47
1.65
14899005--14899033
3
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3
100
0
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0
0
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0
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0
0
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0.90
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29
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0
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7
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1.77
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131
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437
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19
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1.97
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31
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1.59
14929567--14929643
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2.6
25
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10
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5
7
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1.95
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22
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14
74
31
15
27
26
1.95
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2.4
13
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5
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12
0
0
87
0.54
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26
2.7
27
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14
73
41
4
0
54
1.19
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19
1.9
19
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0
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35
2
0
62
1.10
14945657--14945694
20
1.9
20
100
0
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42
26
15
15
1.87
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8
100
0
56
39
0
10
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1.37
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18
3.3
18
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28
57
24
50
7
18
1.72
14958024--14958089
30
2.2
30
100
0
132
27
51
6
15
1.66
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23
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25
70
15
87
32
6
4
56
1.46
14958711--14958777
25
2.9
22
78
10
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29
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5
58
1.46
14958645--14958815
77
2.2
73
76
14
162
31
5
4
58
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14964568--14964592
13
1.9
13
100
0
50
0
12
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80
0.92
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49
86
8
431
34
14
22
29
1.93
14974996--14975348
196
1.8
196
92
0
598
34
14
22
28
1.93
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3.0
37
94
1
195
37
16
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24
1.93
14974982--14975337
150
2.4
149
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458
34
14
21
29
1.93
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30
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1
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0
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0
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25
24
29
21
1.99
14983666--14983833
73
2.3
73
90
1
255
25
17
21
35
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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