Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  258  of  318  ( 38109 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
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26
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29
1.96
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1.9
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87
6
226
26
15
28
29
1.96
82575627--82575807
82
2.2
81
82
4
222
26
15
28
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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2.0
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29
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2.0
214
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20
27
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.99
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275
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20
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1.99
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40
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24
20
27
27
1.99
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1.9
118
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300
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1.99
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12.7
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1.82
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2.0
80
88
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239
29
24
7
37
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82717373--82717558
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6.9
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10
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1.87
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22.3
27
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20
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4.7
40
87
5
234
25
27
22
24
1.99
82720791--82721009
80
2.7
79
82
7
230
25
27
21
25
1.99
82722084--82722259
56
3.1
56
99
0
343
22
23
9
44
1.81
82728730--82728915
40
4.7
40
86
5
225
26
27
21
24
1.99
82729990--82730165
56
3.1
56
99
0
343
22
23
9
44
1.81
82732209--82732354
27
5.4
27
88
3
222
29
26
6
36
1.82
82732290--82732561
27
10.2
27
76
5
117
37
24
8
29
1.84
82732382--82732563
54
3.4
54
78
5
145
40
23
8
28
1.83
82732358--82732562
81
2.6
79
81
6
216
40
23
8
27
1.84
82732546--82733137
27
22.3
27
86
3
745
34
20
20
25
1.96
82732431--82732591
81
2.0
81
82
4
200
37
23
11
27
1.90
82732773--82732812
19
2.1
19
100
0
80
27
20
25
27
1.99
82733566--82733627
22
2.8
22
82
7
72
24
20
20
33
1.97
82733785--82733886
27
3.8
26
81
5
105
20
21
20
37
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82734042--82734203
6
26.8
6
77
15
165
19
16
14
49
1.80
82734017--82734203
30
6.4
30
83
9
233
19
17
14
48
1.81
82734017--82734203
85
2.2
85
96
0
338
19
17
14
48
1.81
82736463--82736494
15
2.0
17
88
11
50
25
0
31
43
1.55
82737893--82737925
13
2.6
13
90
4
50
39
0
12
48
1.40
82743228--82743265
14
2.7
14
92
8
60
18
2
0
78
0.86
82743233--82743266
5
6.8
5
87
12
52
17
2
0
79
0.86
82746142--82746174
13
2.6
13
90
4
50
39
0
12
48
1.40
82754572--82754623
23
2.3
23
83
9
63
65
5
7
21
1.40
82766532--82766570
20
2.0
20
85
5
53
53
20
2
23
1.57
82784194--82784365
47
3.6
47
76
10
141
26
18
29
25
1.98
82784098--82784365
46
5.7
47
73
11
169
27
18
29
25
1.98
82788849--82788892
17
2.5
18
81
3
54
15
38
25
20
1.92
82794767--82794810
18
2.5
18
85
10
56
38
4
6
50
1.50
82800005--82800125
44
2.8
43
80
6
120
30
23
16
28
1.96
82800861--82800899
17
2.3
17
100
0
78
69
5
5
20
1.28
82801833--82801902
34
2.1
33
89
2
104
50
14
12
22
1.77
82802215--82802259
22
2.1
22
84
8
58
51
31
0
17
1.46
82802961--82802996
18
2.0
18
94
0
63
36
22
0
41
1.54
82807754--82807794
21
2.0
21
100
0
82
34
0
9
56
1.32
82807828--82808019
61
3.3
58
68
25
145
41
1
3
54
1.23
82807769--82808077
117
2.6
119
95
2
552
42
1
4
51
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82807960--82808178
102
2.2
102
95
0
395
43
1
3
51
1.28
82808166--82808205
14
2.9
15
82
14
50
47
0
0
52
1.00
82808353--82808449
44
2.2
45
85
5
126
34
27
6
31
1.82
82808429--82808493
16
4.1
16
91
0
103
21
33
6
38
1.78
82808956--82809014
25
2.3
26
76
5
66
23
5
11
59
1.52
82813867--82813905
20
2.0
20
95
5
71
48
0
0
51
1.00
82818276--82818354
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2.1
37
90
0
122
25
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18
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1.98
82818473--82819048
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12.1
47
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2
927
28
29
9
32
1.88
82818473--82819048
96
6.0
96
92
3
925
28
29
9
32
1.88
82818473--82819048
143
4.0
143
94
0
976
28
29
9
32
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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