Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  16  of  318  ( 38109 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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45
0
2
52
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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Entropy
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21
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21
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26
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2.0
33
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33
1
3
61
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6335862--6335911
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18
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2
2
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1.20
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0
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10
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1.70
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1.67
6360424--6360582
78
2.0
78
96
0
291
31
26
8
33
1.87
6365158--6365192
2
17.5
2
100
0
70
51
0
48
0
1.00
6387996--6388056
23
2.5
24
75
12
63
68
6
3
21
1.27
6388414--6388449
16
2.2
16
90
0
54
36
8
0
55
1.30
6388887--6388920
17
2.1
16
88
5
50
44
2
8
44
1.50
6399802--6399826
13
1.9
13
100
0
50
32
12
8
48
1.69
6412470--6412529
20
3.0
20
100
0
120
15
25
25
35
1.94
6414179--6414215
17
2.1
18
90
5
58
54
0
0
45
1.00
6415350--6415387
20
1.9
20
88
0
58
44
7
13
34
1.72
6415358--6415426
20
3.5
20
74
4
59
39
8
13
39
1.75
6415399--6415452
27
2.0
27
85
0
72
37
5
16
40
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6415674--6415748
20
3.8
20
79
8
64
37
5
18
38
1.74
6415677--6415789
60
1.9
60
83
0
145
36
5
19
38
1.75
6415682--6415930
20
12.3
20
67
13
80
34
4
21
39
1.73
6415844--6415929
40
2.3
37
84
8
102
34
3
20
40
1.70
6415985--6416061
40
1.9
39
89
7
120
42
5
14
37
1.68
6415985--6416159
20
8.8
20
72
6
106
40
6
15
38
1.73
6416310--6416444
20
6.8
20
75
1
101
40
5
14
40
1.68
6416294--6416425
60
2.2
60
83
0
165
43
3
15
37
1.65
6417966--6417999
14
2.3
15
95
5
61
5
32
0
61
1.20
6420409--6420929
132
4.0
132
85
3
638
33
19
19
27
1.96
6420413--6420931
263
2.0
264
84
4
690
34
19
19
27
1.96
6423046--6423130
24
3.5
23
87
9
116
23
23
21
31
1.98
6438691--6438721
3
10.3
3
92
0
53
64
3
0
32
1.09
6438929--6438953
13
1.9
13
100
0
50
20
0
16
64
1.30
6448427--6448479
23
2.3
23
96
0
97
43
13
26
16
1.85
6451939--6451968
15
2.0
15
93
0
51
33
40
3
23
1.71
6451988--6452607
48
12.9
48
75
7
524
25
50
2
21
1.62
6451954--6452607
96
6.8
96
93
1
1024
25
50
3
21
1.63
6452596--6452663
21
3.2
21
77
8
59
17
61
2
17
1.46
6452611--6452665
21
2.6
21
79
0
65
16
63
1
18
1.39
6454388--6454445
31
1.9
30
82
10
73
27
6
13
51
1.66
6464205--6464230
5
5.2
5
100
0
52
61
0
0
38
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6469063--6469100
18
2.1
18
90
0
58
34
28
18
18
1.95
6471171--6471282
42
2.7
42
85
0
152
33
26
8
30
1.87
6471245--6471428
50
3.7
49
84
6
219
32
26
13
27
1.93
6474430--6474468
18
2.2
17
86
13
53
33
0
20
46
1.51
6474694--6474791
23
4.3
23
90
2
162
20
21
26
31
1.98
6474696--6474784
45
2.0
45
95
0
160
19
22
26
31
1.97
6481802--6481840
18
2.2
17
86
13
53
33
0
20
46
1.51
6482066--6482163
23
4.3
23
90
2
162
20
21
26
31
1.98
6482068--6482156
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2.0
45
95
0
160
19
22
26
31
1.97
6484960--6485019
31
1.9
32
96
3
113
25
16
3
55
1.57

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318