Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  269  of  318  ( 38109 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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2.0
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2.2
12
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0
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50
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1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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86084178--86084246
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2
120
36
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0
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55
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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25
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17
1.9
19
88
11
56
42
8
0
48
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86181166--86181209
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1
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2.0
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0
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20
6
30
1.76
86192542--86192579
18
2.1
18
90
0
58
50
2
34
13
1.55
86195059--86195171
6
18.8
6
79
10
52
25
35
3
35
1.73
86195102--86195142
12
3.4
12
86
0
64
24
46
9
19
1.80
86195149--86195227
6
13.2
6
72
15
56
21
32
0
45
1.52
86207797--86207880
26
3.2
26
96
0
150
35
23
5
34
1.80
86213611--86213694
26
3.2
26
96
0
150
35
23
5
34
1.80
86214218--86214252
18
1.9
18
94
0
61
28
14
22
34
1.93
86214541--86214599
30
2.0
30
90
6
93
20
44
0
35
1.52
86215686--86215785
50
2.1
49
80
16
111
35
20
3
42
1.67
86219226--86219307
23
3.7
22
76
16
89
37
18
19
24
1.94
86222119--86222241
42
2.9
42
80
4
140
33
26
17
21
1.96
86222124--86222295
44
4.0
43
77
9
154
33
25
18
22
1.96
86228200--86228263
31
2.1
31
93
0
110
39
10
18
31
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86228915--86228955
18
2.2
20
82
8
50
24
2
4
68
1.22
86230566--86230628
21
3.0
21
90
4
92
23
26
23
25
2.00
86231671--86231965
163
1.8
163
84
5
409
40
12
18
28
1.87
86233262--86233324
6
10.3
6
86
3
81
14
15
3
66
1.37
86235612--86236181
48
11.8
48
79
0
584
26
27
16
28
1.97
86235612--86236181
96
5.9
96
88
0
791
26
27
16
28
1.97
86242133--86242177
18
2.5
18
96
0
81
28
28
13
28
1.94
86245448--86245560
56
2.0
56
96
0
208
38
15
14
31
1.87
86248910--86248939
15
2.0
15
100
0
60
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0
0
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0.92
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19
2.4
19
76
20
51
63
4
2
30
1.26
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5
6.2
5
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7
55
75
0
3
21
0.95
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79
2.0
79
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0
294
43
22
10
23
1.84
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39
2.4
39
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0
116
25
26
18
29
1.98
86275608--86275654
3
15.7
3
95
0
85
0
36
0
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0.94
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12
5.8
12
72
12
63
55
0
1
42
1.08
86277663--86277692
11
2.7
11
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0
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23
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30
1.80
86281000--86281057
24
2.4
24
100
0
116
34
10
17
37
1.84
86280993--86281080
31
3.1
31
78
21
127
32
10
18
38
1.84
86281257--86281334
36
2.2
36
90
0
120
14
8
25
51
1.71
86282218--86282260
15
2.6
16
78
14
52
48
16
18
16
1.81
86282227--86282257
15
2.1
15
100
0
62
48
12
19
19
1.81
86289045--86289078
17
2.0
17
88
0
50
14
17
26
41
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86290300--86290355
27
2.1
26
86
3
76
32
1
5
60
1.29
86295347--86295386
15
2.7
15
80
0
53
27
12
2
57
1.48
86300549--86300606
24
2.3
24
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15
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67
1.41
86300534--86300619
32
2.7
31
77
15
88
15
12
6
65
1.46
86300734--86300763
14
2.2
14
94
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53
20
0
6
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3.5
42
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167
32
14
22
30
1.93
86312673--86312706
16
2.1
16
94
0
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38
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23
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100
0
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19
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20
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11
65
26
24
20
28
1.99
86325082--86325238
43
3.7
42
77
13
126
33
22
14
28
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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