Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  21  of  318  ( 38109 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8099886--8099967
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13
50
39
0
5
54
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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1.98
8136178--8136379
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3.3
62
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2
307
26
26
18
28
1.98
8136171--8136379
93
2.2
93
88
3
296
26
26
18
28
1.98
8136357--8136533
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3.5
50
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20
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1.9
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15
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19
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2
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51
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122
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2
33
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0
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0
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22
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59
2
0
38
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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2
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2.0
17
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3
6
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2.1
28
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89
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7
42
1.58
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2.3
27
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6
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42
100
0
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2
6
46
1.42
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2.0
55
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5
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2.0
33
100
0
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17
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0
0
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1
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20
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1.97
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19
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0
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20
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32
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19
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1.95
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21
15
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1.95
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17
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18
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1.89
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2.2
20
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0
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35
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2
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1.62
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46
6.9
46
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0
397
39
15
24
20
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8183900--8183932
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2.0
17
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0
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15
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1.93
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18
2.6
18
89
0
67
38
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46
1.60
8186616--8186693
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3.7
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98
0
147
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2.2
24
89
0
77
55
9
1
32
1.43
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2.0
68
100
0
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5
10
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2.0
28
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3
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3
3
27
1.27
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21
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0
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4.7
47
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1
313
27
30
8
33
1.87
8233373--8233754
40
9.6
40
83
5
339
25
27
21
24
2.00
8235610--8235688
37
2.1
37
88
0
113
26
31
17
24
1.97
8235809--8235982
47
3.7
47
88
1
206
27
31
9
32
1.88
8235807--8235982
94
1.9
94
83
2
228
26
31
9
32
1.88
8238816--8238854
7
5.6
7
96
0
60
33
0
0
66
0.92
8238802--8238862
14
4.1
15
81
8
72
29
0
1
68
0.99
8238802--8238861
15
4.1
14
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10
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30
0
1
68
0.99
8239746--8239947
41
4.9
41
86
5
264
21
25
20
32
1.98
8239746--8239959
83
2.6
81
86
4
268
21
24
20
33
1.97
8250947--8250987
15
2.7
15
78
14
57
60
9
17
12
1.57
8263702--8263732
16
1.9
16
93
0
53
41
0
3
54
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8263812--8263842
12
2.6
12
94
0
53
74
0
25
0
0.82
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16
1.9
16
93
0
53
41
0
3
54
1.16
8271446--8271476
12
2.6
12
94
0
53
74
0
25
0
0.82
8279923--8279980
30
1.9
30
92
0
98
24
8
10
56
1.60
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11
2.9
12
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13
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0
0
33
0.92
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2.1
30
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3
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41
3
1
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1.26
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27
2.0
27
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0
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9
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3
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1.40
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2.2
24
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0
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9
1
32
1.43
8307709--8307774
35
1.9
34
90
6
107
34
7
12
45
1.70
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51
2.2
51
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0
202
29
23
14
32
1.94
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21
2.5
21
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17
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42
13
5
38
1.68
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31
2.1
31
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0
110
32
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29
1.92
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22
2.0
22
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15
4
4
75
1.14
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16
2.1
16
94
0
59
50
2
0
47
1.16
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35
0
7
56
1.28
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46
7.0
46
91
0
435
38
15
24
21
1.92
8352700--8352731
10
3.2
10
100
0
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28
28
9
34
1.88
8354459--8354550
41
2.3
39
79
11
96
46
15
0
38
1.46
8363434--8363481
25
1.9
25
83
8
62
58
2
4
35
1.29
8365796--8365830
17
2.1
18
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10
56
51
0
0
48
1.00
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48
1.9
48
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125
49
1
1
48
1.15
8373662--8373758
48
2.0
48
84
7
126
43
0
0
56
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8373706--8373789
42
2.0
44
86
6
120
41
1
0
57
1.06
8373706--8373779
14
5.1
16
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22
65
40
0
0
59
0.97
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61
2.3
61
97
0
269
33
22
10
33
1.87
8376902--8376954
6
8.5
6
83
8
61
18
0
5
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0.99
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2.0
21
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32
0
0
67
0.91
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29
2.4
29
90
0
120
33
24
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1.91
8387666--8387703
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2.5
15
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4
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68
0
31
0
0.90
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16
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55
0
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1.31
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18
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2
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30
7
14
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1.72
8391229--8391327
23
4.3
23
90
0
153
29
26
21
23
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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