Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  299  of  318  ( 38109 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95099450--95099579
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1.90
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2.8
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3
200
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0
45
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1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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25
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22
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21
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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1.92
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0
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2.0
19
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0
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73
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95300686--95300754
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18
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142
37
12
11
39
1.79
95316416--95316520
35
2.9
35
94
4
174
37
12
11
39
1.79
95329706--95329788
42
2.0
42
81
9
98
54
10
15
19
1.70
95333967--95333999
3
11.0
3
93
0
57
3
30
0
66
1.06
95337257--95337391
39
3.4
39
74
11
116
28
27
20
23
1.99
95338954--95338984
5
6.0
5
92
7
53
61
0
0
38
0.96
95340004--95340096
39
2.4
39
82
5
109
23
22
27
25
2.00
95339963--95340097
39
3.4
39
72
11
107
24
20
26
28
1.99
95345396--95345447
27
1.9
27
96
0
95
28
23
11
36
1.90
95347766--95347804
17
2.3
17
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8
53
28
2
5
64
1.28
95351486--95351537
23
2.3
23
100
0
104
23
21
25
30
1.99
95358251--95358299
25
2.0
25
84
4
64
42
0
0
57
0.99
95358437--95358489
16
3.3
16
86
0
79
39
5
30
24
1.78
95361065--95361214
75
2.0
75
98
0
291
48
18
12
21
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95365996--95366071
38
2.0
38
100
0
152
34
42
2
21
1.67
95368498--95368538
15
2.7
16
88
11
68
58
0
0
41
0.98
95369096--95369135
15
2.8
14
79
20
55
27
0
2
70
1.01
95374613--95374676
23
2.8
23
90
0
101
35
39
3
21
1.70
95375860--95375914
3
18.0
3
77
3
56
30
1
5
61
1.29
95380971--95380998
14
2.0
14
100
0
56
35
21
28
14
1.92
95390888--95390927
18
2.4
16
91
8
62
5
10
0
85
0.75
95391094--95391556
73
6.3
73
81
7
517
27
16
22
33
1.95
95391094--95391556
148
3.1
146
84
7
580
27
16
22
33
1.95
95392706--95392746
22
1.9
22
90
5
66
7
14
2
75
1.12
95393388--95393427
15
2.8
15
92
7
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25
5
0
70
1.08
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29
1.9
29
88
0
85
50
7
5
37
1.53
95397162--95397201
21
2.0
20
85
14
55
45
5
25
25
1.73
95397162--95397201
20
2.0
21
85
14
57
45
5
25
25
1.73
95398638--95398691
21
2.5
21
75
3
54
66
1
5
25
1.23
95399045--95399098
27
2.0
26
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3
63
53
1
16
27
1.53
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7
4.0
7
100
0
56
0
28
14
57
1.38
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3
11.3
3
100
0
68
64
0
0
35
0.94
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43
2.0
43
93
0
145
33
11
12
41
1.80
95410147--95410208
28
2.2
29
83
13
76
38
3
14
43
1.62
95412336--95412381
22
2.1
22
95
0
83
23
17
19
39
1.92
95425634--95425680
8
5.9
8
80
7
51
59
4
2
34
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95425912--95425978
14
4.9
14
69
18
52
61
1
2
34
1.20
95425889--95425966
31
2.5
31
81
6
79
58
3
5
32
1.38
95425830--95426053
25
9.0
25
70
15
101
56
4
5
34
1.41
95425830--95426001
27
6.6
27
69
18
82
55
4
5
34
1.43
95426540--95426772
30
7.8
30
91
1
380
22
3
48
25
1.66
95426540--95426770
59
3.9
59
97
1
426
22
3
48
25
1.66
95426540--95426772
89
2.6
90
91
2
389
22
3
48
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1.66
95437913--95437960
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3.1
15
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2
2
31
1.16
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2.3
24
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69
66
1
1
30
1.12
95437909--95437960
8
6.5
8
82
8
61
65
1
1
30
1.14

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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