Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  284  of  318  ( 38109 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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Period
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Copy
Number
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Indels
Score
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22
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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29
20
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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2
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64
0
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23
1
28
1.59
90948326--90948419
46
2.0
46
89
0
143
44
23
2
29
1.65
90948644--90948741
42
2.4
40
82
3
115
21
18
19
40
1.91
90948775--90948800
12
2.2
12
100
0
52
46
30
15
7
1.74
90949473--90949517
21
2.1
21
91
0
72
15
24
22
37
1.93
90954129--90954204
13
5.3
14
74
25
70
68
0
3
27
1.07
90954809--90954931
61
2.0
61
100
0
246
38
19
14
27
1.91
90958408--90958449
19
2.2
20
91
4
68
54
0
4
40
1.21
90961822--90961878
24
2.3
24
81
3
69
59
5
5
29
1.41
90961793--90961889
24
3.9
24
72
9
68
58
4
6
30
1.41
90961883--90961965
30
2.7
31
80
9
82
59
1
4
34
1.27
90961978--90962026
22
2.2
23
85
7
75
63
2
8
26
1.34
90962065--90962183
26
4.5
26
72
9
98
57
1
10
31
1.42
90962158--90962200
17
2.6
16
79
17
52
58
0
6
34
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90962139--90962278
42
3.1
42
73
16
109
60
2
6
30
1.36
90966500--90966597
48
2.0
48
100
0
196
46
6
18
28
1.72
90966503--90966578
24
3.2
24
65
20
68
47
6
19
26
1.74
90970542--90970602
12
5.1
12
75
0
59
16
26
1
55
1.50
90970542--90970602
24
2.5
24
81
0
68
16
26
1
55
1.50
90975052--90975102
24
2.2
23
96
3
93
31
23
9
35
1.87
90977346--90977418
32
2.5
27
70
19
65
24
2
19
53
1.58
90978625--90978671
13
3.5
13
77
11
58
57
2
0
40
1.11
90978788--90978818
14
2.2
14
100
0
62
48
12
0
38
1.42
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2.0
21
100
0
84
47
4
9
38
1.57
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7
3.7
7
100
0
52
15
0
0
84
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23
2.5
23
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5
98
40
5
21
33
1.75
90986575--90986625
24
2.1
25
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10
79
33
0
5
60
1.21
90991328--90991361
6
5.5
6
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6
50
14
2
0
82
0.79
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4
87
6
52
54
0
0
45
0.99
90995012--90995045
16
2.2
15
94
5
59
55
0
0
44
0.99
90996635--90996665
16
1.9
16
93
0
53
74
3
0
22
0.96
91001147--91001184
19
2.1
19
85
9
53
50
5
0
44
1.24
91001357--91001385
11
2.6
11
100
0
58
37
6
20
34
1.80
91007290--91007506
40
5.5
40
83
6
246
25
28
23
23
1.99
91007323--91007506
79
2.3
79
86
8
241
26
28
23
21
1.99
91018722--91018839
44
2.6
46
77
4
123
27
19
23
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91019005--91019127
44
2.8
44
91
2
185
30
21
25
22
1.98
91019016--91019354
88
3.8
88
71
13
205
32
19
25
23
1.98
91019208--91019407
44
4.5
44
72
9
104
32
18
23
26
1.97
91021011--91021036
11
2.4
11
100
0
52
15
0
0
84
0.62
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3
47.7
3
71
16
70
64
2
6
26
1.32
91024870--91025216
3
115.0
3
69
14
126
59
3
8
28
1.44
91024952--91024990
20
2.0
20
89
0
60
53
10
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91025876--91025909
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0
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0.85
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127
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128
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423
36
21
17
24
1.95
91040282--91040307
3
8.7
3
100
0
52
34
0
0
65
0.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318