Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A05
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  100714657

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   

This is table  305  of  318  ( 38109 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.91
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Period
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Number
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Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
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64
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
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6
1.06
96881455--96881488
16
2.2
15
94
5
59
29
0
0
70
0.87
96881546--96881593
15
3.3
15
80
11
55
27
8
0
64
1.22
96886842--96886920
28
2.6
28
78
9
77
50
13
6
29
1.66
96886858--96886920
28
2.1
28
85
8
81
49
14
6
30
1.68
96893529--96893598
30
2.4
30
79
13
83
34
12
4
48
1.61
96897331--96897357
3
9.0
3
100
0
54
33
0
33
33
1.58
96913073--96913135
32
2.0
32
100
0
126
44
11
19
25
1.83
96916600--96916651
20
2.5
21
75
6
52
67
0
1
30
1.02
96916855--96916887
15
2.1
16
94
5
59
69
9
0
21
1.15
96918124--96918180
22
2.5
22
75
13
62
19
10
1
68
1.28
96920310--96920358
20
2.5
20
78
15
57
20
16
18
44
1.86
96921533--96921991
228
2.0
228
86
2
645
33
22
10
34
1.87
96924738--96924814
38
2.0
38
100
0
154
18
23
20
37
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96928520--96928563
17
2.7
15
83
13
52
47
2
0
50
1.13
96932449--96932506
25
2.5
22
77
20
64
48
1
1
48
1.22
96934000--96934056
27
2.1
27
80
6
62
54
1
0
43
1.10
96936448--96936482
8
4.4
8
89
10
54
88
0
0
11
0.51
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9
3.4
9
90
9
53
90
0
0
10
0.47
96936448--96936482
17
2.1
17
94
5
63
88
0
0
11
0.51
96936984--96937023
21
1.9
21
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0
53
20
5
10
65
1.42
96937207--96937251
3
15.0
3
90
0
63
28
2
4
64
1.25
96937081--96937386
161
1.9
161
80
9
365
29
5
5
60
1.41
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17
2.1
17
88
0
52
34
0
5
60
1.21
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22
2.0
22
82
8
54
29
4
6
59
1.44
96941165--96941202
20
2.0
20
84
5
51
52
10
0
36
1.36
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80
2.0
80
91
0
257
41
10
13
35
1.79
96948417--96948470
27
2.1
27
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6
76
27
5
9
57
1.52
96951849--96952163
162
1.9
163
90
1
508
29
14
15
39
1.88
96953168--96953218
25
2.0
25
100
0
102
35
11
11
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1.78
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18
2.0
18
88
0
54
25
0
13
61
1.33
96969037--96969097
28
2.1
31
87
9
92
50
6
14
27
1.68
96969041--96969111
28
2.5
28
82
8
83
53
5
16
23
1.64
96969269--96969363
48
2.0
48
85
0
127
53
3
20
23
1.59
96984992--96985045
2
27.0
2
100
0
108
0
50
0
50
1.00
96985216--96985240
3
8.3
3
100
0
50
36
0
64
0
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96985515--96985555
19
2.1
20
86
13
59
39
0
4
56
1.21
96986908--96986954
20
2.4
20
86
10
62
65
0
0
34
0.93
96989758--96989813
25
2.4
23
80
16
62
55
8
7
28
1.57
96991148--96991201
26
2.1
26
100
0
108
18
14
29
37
1.91
96994971--96995030
30
2.0
30
86
0
84
33
25
5
36
1.78
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46
90
1
541
21
23
14
40
1.90
97000303--97000462
43
3.7
42
75
17
141
28
26
20
24
1.99
97000303--97000461
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3.7
44
74
18
154
28
26
20
24
1.99
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85
83
8
210
29
26
20
24
1.99
97008739--97008782
23
1.9
23
81
9
54
61
6
2
29
1.34

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318