Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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This is table  102  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28421456--28421488
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17
1.95
28434221--28434335
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2.1
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36
22
23
17
1.95
28434436--28434511
28
2.8
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1.94
28439988--28440101
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160
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22
23
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0
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2.1
21
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138
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40
80
2
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1.98
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2.2
40
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2.3
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94
32
19
12
35
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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2.0
30
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100
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2.0
20
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7
35
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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24
20
30
1.98
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5.4
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24
24
20
30
1.99
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2.7
262
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24
24
20
30
1.98
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1.97
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65
67
0
6
26
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28582363--28582461
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64
0
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27
1.21
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2.8
15
75
20
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60
0
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29
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14
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1.15
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23
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21
21
37
1.95
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21
21
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19
20
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41
3.5
41
67
17
122
18
19
22
40
1.92
28587505--28587570
33
2.0
33
100
0
132
36
12
12
39
1.80
28593571--28593624
23
2.5
23
82
8
60
61
5
0
33
1.19
28593824--28593876
21
2.6
21
81
3
63
67
0
7
24
1.16
28594468--28594494
5
5.4
5
100
0
54
81
0
0
18
0.69
28594974--28595020
19
2.5
20
86
6
62
40
10
23
25
1.87
28598703--28598741
20
2.0
20
85
10
53
69
0
2
28
1.02
28598816--28599188
3
125.7
3
65
15
82
60
4
6
29
1.40
28598900--28598943
20
2.2
21
80
12
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59
0
2
38
1.10
28599161--28599195
15
2.2
16
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5
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2
2
31
1.24
28603312--28603346
13
2.7
13
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0
52
31
8
20
40
1.82
28611616--28611842
40
5.7
39
77
6
154
27
22
25
24
2.00
28611664--28611813
80
1.9
80
82
8
189
28
23
26
22
1.99
28619818--28619970
39
3.9
39
88
0
216
24
30
20
24
1.99
28619787--28619969
78
2.3
78
87
5
260
23
30
22
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28623793--28624000
40
5.2
39
82
3
202
25
25
23
25
2.00
28626569--28626613
20
2.2
20
92
0
72
33
0
15
51
1.44
28626575--28626632
20
2.6
23
73
18
68
41
0
10
48
1.37
28626721--28626822
40
2.5
40
82
7
116
30
19
14
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1.92
28628020--28628053
6
5.7
6
100
0
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0
35
1.58
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18
1.9
17
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5
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2
0
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1.15
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2.0
24
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0
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2
0
35
1.07
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22
2.0
24
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0
0
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2.0
23
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4
4
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1.43
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2.4
21
70
3
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44
3
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42
1.55
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16
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0
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16
2.1
16
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0
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0
0
38
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2.1
13
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0
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7
55
1.64
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1.9
41
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104
20
17
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30
1.96
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2.0
38
100
0
154
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1.96
28658642--28658682
18
2.3
18
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51
2
2
43
1.28
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2.7
12
100
0
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6
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0
0.95
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20
2.0
20
100
0
78
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5
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1.48
28663346--28663403
22
2.6
22
100
0
116
22
32
34
10
1.88
28669124--28669184
30
2.0
30
83
0
77
31
24
3
40
1.71
28675280--28675307
7
4.0
7
100
0
56
85
0
0
14
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28676732--28676784
21
2.7
20
85
5
63
39
0
7
52
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28676956--28676991
2
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2
100
0
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0
0
50
1.00
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2.0
136
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0
528
38
12
19
29
1.89
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5
10.4
5
82
8
50
0
0
20
79
0.74
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27
2.8
27
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0
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22
24
25
28
2.00
28684642--28684726
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2.6
33
84
0
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27
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1.84
28684668--28684767
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3.0
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28
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1.86
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2.2
25
100
0
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0
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99
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34
25
20
19
1.96
28695755--28695838
30
2.7
31
89
7
136
25
22
17
34
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          321   322   323   324   325   326   327   328