Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  287  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
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6
7
44
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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2.8
173
82
7
626
26
24
16
32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85960699--85960886
99
1.9
99
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25
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96
0
317
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29
21
20
1.98
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3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
85983225--85983396
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
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12
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20
1.98
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93
94
0
308
27
30
21
20
1.98
85990771--85990946
46
3.8
46
79
12
207
28
30
21
19
1.98
86001367--86001413
23
2.0
23
83
0
58
55
8
6
29
1.55
86007282--86007308
12
2.2
12
100
0
54
14
14
37
33
1.88
86009529--86009577
22
2.2
23
82
10
57
61
0
12
26
1.31
86011064--86011107
18
2.5
18
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3
63
38
6
0
54
1.27
86011130--86011182
14
3.5
15
85
12
56
35
1
0
62
1.06
86011110--86011191
29
3.0
27
77
10
78
39
1
1
58
1.14
86021349--86021404
27
2.0
27
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3
103
46
14
17
21
1.84
86021830--86021880
16
3.1
16
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13
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56
1
0
41
1.10
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2
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2
90
0
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4
1.22
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2.0
38
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0
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1.66
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9
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9
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12
0
21
66
1.23
86028484--86028639
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42
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12
149
27
17
21
32
1.96
86029217--86029287
33
2.1
34
86
2
99
26
25
19
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86038445--86038514
35
2.0
35
100
0
140
37
14
28
20
1.91
86046809--86046965
43
3.7
43
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10
115
22
15
28
33
1.95
86049323--86049465
39
3.6
39
89
2
207
22
30
20
27
1.98
86053109--86053170
30
2.0
31
84
6
81
38
0
12
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1.42
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6
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0
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0
0
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0.65
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2.9
14
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10
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34
0
9
55
1.32
86062643--86062675
14
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15
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5
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30
0
6
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1.18
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13
2.3
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54
0
3
42
1.15
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2.0
27
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0
1
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5
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0
58
0
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0
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1.9
24
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29
9
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59
1.41
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24
3.4
24
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27
21
15
34
1.94
86094451--86094577
50
2.6
48
78
7
121
29
20
17
32
1.95
86094681--86094718
20
1.9
20
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0
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7
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39
1.73
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3.5
39
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139
41
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32
1.78
86096483--86096526
23
2.0
23
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29
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1.26
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6
100
0
76
18
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0
31
1.47
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22
2.0
22
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0
63
33
13
8
44
1.75
86101707--86101922
47
4.6
46
85
2
270
25
28
11
33
1.91
86101722--86101922
94
2.1
94
89
0
303
24
28
12
33
1.92
86103497--86103521
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
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40
7.0
39
81
8
258
25
28
22
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86106070--86106346
79
3.5
78
76
12
251
25
28
22
23
1.99
86109209--86109432
40
5.6
39
80
11
208
22
23
28
25
1.99
86109249--86109432
79
2.3
80
89
0
271
22
23
28
25
2.00
86109209--86109426
119
1.8
120
86
3
314
22
23
28
24
1.99
86109249--86109455
79
2.6
79
85
3
265
23
23
28
25
2.00
86111137--86111227
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2.0
46
86
0
128
26
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8
32
1.87
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47
5.1
46
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3
273
25
29
11
33
1.91
86111198--86111436
94
2.5
93
84
4
309
25
29
11
33
1.91
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2.0
29
93
0
100
42
8
22
27
1.82
86116917--86116970
16
3.4
16
89
5
83
38
0
27
33
1.57

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          321   322   323   324   325   326   327   328