Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr07 97507971 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  97  of  328  ( 39316 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.98
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1.99
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1.97
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1.9
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0
285
28
26
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5.7
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27132012--27132314
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3.2
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24
27
19
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1.99
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6.7
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77
12
244
22
28
21
27
1.99
27139590--27139903
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3.3
95
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367
22
28
21
27
1.99
27139596--27139903
141
2.2
137
81
9
336
23
28
20
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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62
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201
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27151905--27152908
150
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150
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0
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22
20
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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27197180--27197290
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1.9
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18
26
27
1.98
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2.0
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19
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1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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2
0
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1.12
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19
2.2
18
86
4
55
36
0
4
58
1.20
27258727--27258765
17
2.3
17
86
8
53
43
0
0
56
0.99
27258871--27258905
2
17.5
2
100
0
70
48
0
0
51
1.00
27265659--27265728
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
27268690--27268798
54
2.0
54
100
0
218
11
22
27
39
1.87
27269827--27269930
34
3.1
34
91
2
165
30
21
22
25
1.98
27275878--27275932
17
3.4
17
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10
51
29
21
0
49
1.50
27281002--27281272
40
6.8
40
88
0
371
19
28
19
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1.96
27281075--27281262
20
9.4
20
64
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87
18
30
20
31
1.96
27281002--27281272
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80
90
1
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19
28
19
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1.96
27290185--27290260
27
2.8
27
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4
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32
13
13
40
1.83
27300157--27300397
50
4.9
50
84
3
292
29
17
29
24
1.97
27309744--27309787
21
2.0
22
91
4
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43
22
4
29
1.73
27310307--27310362
24
2.3
24
96
0
103
28
25
3
42
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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2
100
0
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0
0
50
1.00
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19
1.9
18
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5
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38
25
5
30
1.78
27317889--27317932
22
2.0
22
100
0
88
45
0
13
40
1.44
27322671--27322724
24
2.2
23
78
12
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3
18
1
1.03
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2.0
31
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0
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0
0
45
1.00
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30
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35
2
0
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1.10
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2
0
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1.10
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61
1.20
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2
0
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1.09
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2.0
38
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33
3
0
62
1.14
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1.14
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5.2
82
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0
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29
21
24
24
1.99
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2
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2
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44
0
0
55
0.99
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26
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102
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3
0
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3
0
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1.12
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50
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3
0
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1.11
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74
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198
35
3
0
61
1.12
27336267--27336489
61
3.7
60
75
17
201
35
3
0
61
1.12
27336673--27336724
23
2.4
21
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15
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36
5
0
57
1.23
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17
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17
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23
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34
1
0
63
1.04
27338289--27338388
19
5.3
19
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168
36
16
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38
1.82
27338280--27338388
36
2.8
37
89
9
157
37
15
10
36
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27342527--27342569
11
3.8
11
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17
52
62
4
0
32
1.15
27354312--27354393
27
3.0
27
96
0
146
14
29
18
37
1.90
27354738--27354801
31
2.1
31
96
0
119
21
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25
45
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25
2.0
25
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4.0
7
100
0
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0
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12
0
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0.90
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19
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14
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1.79
27380062--27380233
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328