Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  25  of  328  ( 39316 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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1.68
Indices
Period
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Copy
Number
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Indels
Score
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1.9
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15
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4.4
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19
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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19
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58
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136
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11
16
36
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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64
2
0
33
1.08
7489065--7489253
96
2.0
96
97
0
360
38
16
10
34
1.83
7492470--7492597
64
2.0
64
95
0
229
34
20
15
29
1.94
7493804--7493875
38
1.9
37
88
2
108
48
0
5
45
1.25
7494086--7494156
32
2.2
33
90
5
110
35
26
2
35
1.71
7494086--7494157
16
4.5
16
87
3
92
34
26
4
34
1.76
7496827--7496974
49
3.0
49
93
0
242
39
23
13
23
1.90
7499782--7499820
12
3.3
12
85
7
62
0
10
0
89
0.48
7499782--7499819
11
3.4
11
88
3
58
0
10
0
89
0.49
7499782--7499822
19
2.2
19
91
8
66
0
9
0
90
0.46
7502831--7502871
2
20.5
2
100
0
82
51
0
0
48
1.00
7509303--7509387
33
2.5
33
74
12
84
31
1
4
62
1.23
7509572--7509598
10
2.7
10
100
0
54
33
7
29
29
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7519495--7519535
17
2.4
17
80
19
50
51
4
0
43
1.23
7521419--7521476
28
2.1
28
93
0
98
37
6
0
55
1.27
7521433--7521493
28
2.2
28
87
0
86
42
3
1
52
1.27
7522646--7522680
18
1.9
18
88
0
52
40
14
20
25
1.90
7532261--7532331
28
2.5
28
83
4
88
29
18
2
49
1.62
7533485--7533514
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
7535757--7535787
2
15.5
2
100
0
62
48
0
0
51
1.00
7538000--7538034
13
2.6
13
95
4
61
48
14
5
31
1.67
7538204--7538236
14
2.4
14
94
0
57
51
6
18
24
1.68
7548679--7548706
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
7550599--7550647
9
5.4
9
80
0
53
36
22
12
28
1.90
7558407--7558471
18
3.3
20
76
22
59
63
0
6
30
1.19
7558401--7558495
19
5.0
17
75
18
73
63
1
4
31
1.21
7558376--7558495
38
3.2
37
76
15
95
62
0
5
30
1.24
7558425--7558500
20
3.8
20
79
17
88
65
1
3
28
1.18
7558664--7558763
11
9.3
11
66
22
52
34
1
0
65
1.00
7558683--7558749
28
2.4
27
79
16
73
38
0
0
61
0.96
7558698--7558762
10
6.6
10
74
8
53
32
0
0
67
0.91
7558728--7558763
11
3.4
11
84
7
56
25
0
0
75
0.81
7558700--7558762
9
6.6
9
75
18
56
31
0
0
68
0.90
7558897--7559058
90
1.8
88
84
4
218
37
7
18
37
1.79
7583719--7583758
21
1.9
21
94
0
71
25
10
5
60
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7586452--7586522
15
5.1
12
91
8
52
28
0
0
71
0.86
7586456--7586520
9
7.8
8
93
6
71
29
0
0
70
0.87
7586466--7586520
3
18.7
3
96
3
103
30
0
0
69
0.89
7588404--7588548
73
2.0
73
90
5
231
31
13
23
31
1.93
7598280--7598389
26
4.2
26
95
0
175
34
5
22
37
1.78
7599870--7599922
26
2.0
25
82
13
63
35
22
15
26
1.93
7605288--7605317
14
2.1
15
93
6
53
13
13
10
63
1.52
7609172--7609225
27
2.1
26
82
6
65
53
7
3
35
1.47
7609288--7609342
3
19.7
3
75
14
55
67
1
3
27
1.17
7609288--7609342
11
4.9
11
79
2
65
67
1
3
27
1.17

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328