Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   

This is table  75  of  328  ( 39316 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20602570--20602621
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2.4
22
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0
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51
1.42
20602570--20602628
22
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59
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0
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0
0
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63
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1.9
19
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2
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1.62
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2
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21
24
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25
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0
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13
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62
0
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20623591--20623673
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6.8
12
76
16
73
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1
3
30
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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13
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3
29
1.17
20623591--20623677
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3.4
27
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1
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21
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10
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132
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1517
25
23
19
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68
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22
24
27
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20625710--20626597
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20
21
22
35
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1130
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21
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36
1.96
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261
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21
22
36
1.95
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22
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50
50
0
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47
1.16
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3.5
12
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50
58
4
0
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1.19
20632058--20632153
3
31.0
3
74
14
54
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4
6
28
1.39
20632178--20632263
3
28.3
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19
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65
1
3
30
1.17
20632178--20632260
12
6.8
12
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16
73
65
1
3
30
1.17
20632183--20632263
18
4.4
18
79
13
76
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1
3
29
1.17
20632178--20632264
27
3.4
27
71
19
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1
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29
1.16
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3.1
22
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10
81
61
26
0
11
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.38
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1.40
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11
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38
1.40
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0
0
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1.88
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2
0
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1.48
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22
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1.74
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1.10
20697422--20697469
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1.30
20701204--20701413
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4.8
43
71
8
163
28
20
23
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20701202--20701515
87
3.7
86
85
4
397
28
21
23
27
1.99
20701571--20702021
175
2.6
174
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22
23
20
33
1.97
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66
22
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23
23
21
31
1.98
20701571--20701974
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4.6
88
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354
21
23
21
34
1.97
20701828--20701957
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131
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23
20
32
1.98
20702081--20702261
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2.8
64
94
0
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11
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39
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0
358
41
14
23
20
1.90
20707375--20707426
18
2.7
19
76
11
52
0
19
7
73
1.07
20712584--20712611
11
2.5
11
100
0
56
39
0
7
53
1.28
20714327--20714363
20
1.9
19
89
10
58
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2
0
48
1.15
20716549--20716574
13
2.0
13
100
0
52
15
30
30
23
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20717529--20717567
19
2.1
19
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9
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28
5
7
58
1.47
20723579--20723605
2
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2
100
0
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0
0
51
1.00
20726976--20727039
27
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25
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7
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70
20
4
4
1.24
20726976--20727050
24
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25
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5
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4
1.20
20726976--20727050
25
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26
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1.20
20727801--20727902
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1.41
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12
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0
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1.77
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2.5
221
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2
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31
15
20
31
1.94
20737016--20737578
72
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5
679
31
15
20
31
1.94
20738468--20738516
20
2.4
20
96
3
89
65
28
2
4
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20743372--20743405
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2.4
14
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0
50
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2
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2.8
21
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15
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5
5
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1.46
20743628--20743668
2
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2
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9
50
51
2
2
43
1.28
20743590--20743734
64
2.4
60
80
12
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2
4
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1.32
20743681--20743734
21
2.6
21
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1
0
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1.04
20743681--20743731
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0
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1.96
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16
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1.97
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2.0
233
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1.96
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0
0
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0
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43
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1.99
20771531--20771705
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2.0
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28
20
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1.99
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0
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0
0
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0
0
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301
1.9
303
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6
759
42
5
9
42
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20781428--20782040
156
4.0
151
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622
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5
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42
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2.1
23
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32
1.73
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0
0
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2.0
44
86
4
120
31
13
16
38
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328