Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   

This is table  70  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19211151--19211189
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2.0
20
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1.46
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6
4
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19217741--19217779
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2.1
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90
4
60
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7
0
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1.26
19217745--19217788
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2.3
19
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0
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1.41
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3
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0
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22
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2.4
25
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0
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2.0
58
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5
2
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1.35
19219128--19219192
33
2.0
33
84
6
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35
4
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56
1.35
19219114--19219206
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3.3
27
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13
71
34
6
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1.41
19219197--19219243
25
2.0
24
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2
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16
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2
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30
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1
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2.3
14
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12
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2.8
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1
359
28
17
21
33
1.96
19229645--19229673
14
2.1
14
100
0
58
13
13
6
65
1.45
19229516--19229831
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1.9
166
90
1
499
29
16
21
32
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19229284--19230130
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6
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28
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22
32
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19229683--19230168
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6.5
73
88
4
677
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16
23
31
1.96
19230182--19230223
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11
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19230981--19231081
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3.4
30
98
0
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19230981--19231060
18
5.1
18
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1.66
19231677--19231802
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4.6
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10
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55
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19231691--19231749
25
2.4
25
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0
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1.24
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2.0
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2
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1.34
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2.0
24
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3.1
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19231985--19232036
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82
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22
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156
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490
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19234831--19234873
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2.0
21
82
13
52
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9
6
27
1.57
19235109--19235357
12
20.6
12
71
17
89
59
2
3
33
1.29
19235112--19235178
3
22.3
3
93
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0
0
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24
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12
117
61
2
3
31
1.27
19235109--19235261
21
7.0
23
79
12
91
60
2
3
32
1.28
19235192--19235331
23
6.3
23
72
22
88
57
4
4
33
1.37
19235312--19235343
14
2.3
14
94
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62
0
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34
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19235527--19235563
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1.9
19
88
0
56
59
2
2
35
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
2
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1.15
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2.0
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12
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2.3
15
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0
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100
0
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0
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14
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21
14
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1.29
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2.0
34
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41
5
1
51
1.35
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27
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21
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19266462--19266690
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22
13
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10.7
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100
0
64
65
0
0
34
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19280468--19280548
32
2.5
33
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2
101
17
16
43
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0
0
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2
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1.19
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2
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1.50
19284166--19284239
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4
2
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1.15
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3
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54
0
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0
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15
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4
4
83
0.89
19285590--19285623
14
2.7
12
83
16
50
64
0
0
35
0.94
19290756--19290794
15
2.6
15
80
12
53
43
5
0
51
1.24
19299240--19299269
15
2.0
15
93
0
51
70
0
13
16
1.18
19300023--19300075
18
2.9
18
91
0
88
32
26
15
26
1.95
19303502--19303554
18
2.9
18
88
0
79
26
15
28
30
1.96
19306870--19306895
12
2.2
12
100
0
52
7
7
0
84
0.77
19308170--19308204
11
3.0
12
87
8
54
28
0
5
65
1.15
19318714--19318745
16
2.0
16
100
0
64
25
0
31
43
1.55
19324923--19325188
131
2.0
131
88
2
392
33
17
18
30
1.95
19331517--19331560
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21
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31
11
0
56
1.35
19332391--19332439
24
2.1
23
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11
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32
2
4
61
1.26
19343644--19343683
19
2.1
19
85
0
53
55
0
7
37
1.29
19343722--19343825
20
4.9
20
67
17
59
59
3
1
34
1.27
19343763--19343828
10
6.4
10
74
19
64
60
3
0
36
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19343764--19343829
7
9.0
7
73
15
53
59
3
0
37
1.13
19343777--19343906
28
5.0
25
68
20
72
64
3
2
30
1.21
19343762--19343828
16
4.3
16
81
14
70
61
2
0
35
1.12
19345284--19345838
206
2.7
206
90
2
839
28
22
17
30
1.97
19357635--19357674
19
2.1
19
85
0
53
55
0
7
37
1.29
19357677--19357821
40
3.6
39
73
22
99
59
2
3
35
1.26
19357640--19357810
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4.0
41
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21
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2
3
35
1.28
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7
9.0
7
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1
0
38
1.07
19357750--19357822
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2.9
24
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12
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63
1
1
34
1.12
19357752--19357813
16
3.8
16
83
14
65
61
1
0
37
1.06
19359227--19359259
17
1.9
18
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11
52
51
0
3
45
1.16
19359293--19359326
17
1.9
18
88
5
52
61
0
5
32
1.20
19361408--19361538
70
1.9
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80
4
156
27
12
4
54
1.57
19361572--19361630
7
7.9
7
76
12
55
16
1
5
76
1.05
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2.1
23
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4
60
17
4
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72
1.22
19374786--19374832
19
2.5
19
86
6
60
25
19
10
44
1.82
19382940--19383618
44
14.9
43
72
10
315
32
16
20
29
1.95
19382940--19383886
89
10.3
89
73
9
532
33
17
19
29
1.95
19383386--19383723
51
7.0
51
70
11
194
35
17
18
28
1.93
19383673--19383792
44
2.7
44
80
2
143
34
18
15
32
1.92
19383673--19383809
44
3.1
44
76
4
134
37
18
14
29
1.90
19383578--19383834
139
1.8
141
81
3
322
35
18
16
29
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19390499--19390586
38
2.4
37
82
3
113
44
1
2
52
1.21
19390540--19390574
14
2.4
15
90
4
54
45
0
2
51
1.16
19390499--19390607
38
2.9
37
77
11
105
43
1
3
51
1.30
19393034--19393087
24
2.2
24
93
0
90
38
1
12
46
1.53
19395036--19395093
4
13.2
4
79
16
55
68
3
3
24
1.20
19396821--19397319
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11.0
44
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11
222
30
19
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323
1.9
323
80
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713
29
20
16
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2.4
14
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0
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33
1.72
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3
100
0
56
32
0
0
67
0.91
19409146--19409202
23
2.5
22
76
18
62
71
3
5
19
1.19

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325   326   327   328