Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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This is table  293  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.99
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245
25
26
21
25
1.99
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40
5.2
40
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249
26
27
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27
19
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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2.0
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3
1
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1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.21
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19
26
21
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87603909--87603935
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1
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1
2
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1.24
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1
1
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1.22
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0
0
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15
81
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54
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4
0
44
1.21
87634132--87634172
20
2.0
20
100
0
82
29
17
24
29
1.97
87638835--87638876
12
3.7
11
82
14
50
76
0
9
14
1.02
87638835--87638901
20
3.7
17
84
9
64
79
0
5
14
0.92
87638830--87638904
5
14.2
5
76
20
57
78
0
5
16
0.92
87638835--87638904
11
5.9
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78
0
5
15
0.93
87638829--87638901
38
1.9
38
83
5
94
79
0
5
15
0.90
87638867--87638902
7
5.4
7
90
9
58
86
0
0
13
0.58
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17
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1.46
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40
2.0
40
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0
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19
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87689821--87689853
11
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11
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4
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3
15
0
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0.80
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2
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2
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0
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0
0
50
1.00
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2.7
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12
150
37
10
16
35
1.82
87704569--87704659
19
4.9
19
92
8
161
37
10
15
36
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87704569--87704682
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10
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36
9
15
37
1.81
87714816--87714977
89
1.8
87
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5
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30
19
22
27
1.98
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78
3.8
78
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2
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31
19
23
25
1.98
87715243--87715516
45
6.1
45
80
6
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30
15
28
25
1.96
87715243--87715516
89
3.0
89
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5
329
30
15
28
25
1.96
87715243--87715499
134
1.9
136
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29
15
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1.96
87715879--87715940
18
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17
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1.82
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35
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37
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10
16
36
1.82
87715869--87715940
19
3.9
19
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10
114
36
11
15
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1.83
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3.0
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2.1
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0
0
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2.0
88
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0
343
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3.5
40
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4
250
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22
1.76
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24
2.0
24
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0
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1.63
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40
4.2
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25
23
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25
2.00
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80
81
5
225
24
23
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25
2.00
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40
2.2
39
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2
118
26
17
26
29
1.98
87747273--87747313
12
3.5
12
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15
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46
14
2
36
1.58
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40
3.0
40
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0
155
31
12
23
32
1.92
87752097--87752145
10
4.9
10
82
9
64
20
6
4
69
1.27
87755833--87755871
19
2.1
19
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23
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10
51
1.73
87769687--87769806
48
2.5
48
85
2
154
35
15
21
28
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87773553--87773631
28
2.8
28
90
0
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13
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1.94
87778024--87778105
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2.1
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112
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28
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41
1.81
87778410--87778437
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2.3
12
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0
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1.71
87778466--87778567
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2.5
40
82
0
132
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19
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1.94
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120
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0
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2.3
15
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5
50
24
0
27
48
1.51

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328