Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr07 97507971 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  97507971

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
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This is table  270  of  328  ( 39316 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5.2
40
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305
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28
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1.99
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105
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18
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
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Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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29
84
6
77
26
1
8
63
1.32
81034718--81034762
23
2.0
23
95
0
81
35
0
8
55
1.31
81040426--81040460
15
2.3
15
95
0
61
62
31
0
5
1.18
81040426--81040461
16
2.3
15
90
4
54
63
30
0
5
1.17
81040388--81040491
46
2.2
47
91
1
165
68
23
5
2
1.25
81040439--81040508
30
2.4
29
86
9
97
72
15
5
5
1.22
81040392--81040492
47
2.1
47
89
3
150
71
19
5
2
1.20
81040410--81040504
46
2.1
45
80
5
102
73
15
6
4
1.19
81041041--81041071
2
15.5
2
100
0
62
48
0
0
51
1.00
81040977--81041051
39
1.9
39
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33
6
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1.49
81041174--81041210
18
2.1
18
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5
2
48
1.40
81041232--81041261
15
2.0
15
100
0
60
26
0
6
66
1.16
81043079--81043114
12
3.0
12
95
0
63
27
25
5
41
1.77
81047977--81048132
68
2.2
68
77
13
149
20
28
16
34
1.94
81055440--81055595
68
2.2
68
77
13
149
20
28
16
34
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81058297--81058471
71
2.5
69
84
3
208
29
14
22
34
1.93
81058668--81058701
13
2.5
13
90
4
50
23
11
8
55
1.63
81058565--81058969
140
2.9
140
93
2
679
26
17
19
37
1.93
81058808--81058841
13
2.5
13
90
4
50
20
11
8
58
1.59
81058976--81059116
72
2.0
72
100
0
282
32
17
18
31
1.94
81059070--81059165
49
2.0
49
97
0
183
30
16
20
32
1.95
81058998--81059237
121
2.0
121
94
0
417
29
17
20
32
1.96
81059119--81059316
72
2.8
72
91
0
333
29
16
20
33
1.95
81060120--81060211
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2.0
48
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1.29
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2.3
15
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5
61
58
35
0
5
1.22
81060122--81060221
48
2.1
46
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7
121
71
20
6
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1.21
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2.0
34
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8
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75
13
6
4
1.14
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2
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2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
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2.6
36
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12
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37
5
4
53
1.42
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18
2.1
18
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0
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43
5
2
48
1.40
81060967--81060996
15
2.0
15
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0
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0
6
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1.16
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44
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42
80
9
133
35
23
16
24
1.95
81069119--81069250
42
3.0
42
80
11
135
35
23
16
24
1.95
81074023--81074145
45
2.7
45
87
2
167
21
16
28
33
1.95
81082058--81082117
30
2.0
30
93
0
102
21
10
13
55
1.67
81083250--81083280
15
2.1
15
100
0
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41
19
0
38
1.51
81086690--81086779
36
2.4
38
77
5
103
30
40
15
14
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81091829--81091957
46
2.8
46
91
0
204
28
28
22
20
1.98
81093887--81093962
15
5.2
15
67
17
52
55
15
17
11
1.69
81096867--81096960
46
2.1
45
88
4
136
30
29
19
20
1.97
81098251--81098318
19
3.6
19
74
7
66
75
4
2
17
1.10
81101402--81101441
19
2.1
19
100
0
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32
1.98
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2.2
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0
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25
2.3
25
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7
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0
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1.96
81105227--81105293
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2.0
33
88
2
98
22
23
20
32
1.98
81114081--81114344
30
8.8
30
80
5
282
35
17
14
32
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          321   322   323   324   325   326   327   328